NEIL1

NEIL1
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1TDH, 4NRV, 5ITY, 5ITQ, 5ITU, 5ITX, 5ITR, 5ITT
Ідентифікатори
Символи	NEIL1, FPG1, NEI1, hFPG1, nei like DNA glycosylase 1
Зовнішні ІД	OMIM: 608844 MGI: 1920024 HomoloGene: 11616 GeneCards: NEIL1
Онтологія гена Молекулярна функція • DNA binding • zinc ion binding • hydrolase activity, hydrolyzing N-glycosyl compounds • hydrolase activity, acting on glycosyl bonds • damaged DNA binding • protein C-terminus binding • каталітична активність • lyase activity • nucleic acid binding • hydrolase activity • DNA N-glycosylase activity • DNA-(apurinic or apyrimidinic site) endonuclease activity • class I DNA-(apurinic or apyrimidinic site) endonuclease activity Клітинна компонента • цитоплазма • хромосома • центр організації мікротрубочок • цитоскелет • клітинне ядро • нуклеоплазма Біологічний процес • nucleotide-excision repair • GO:0001306 response to oxidative stress • cellular response to DNA damage stimulus • depyrimidination • negative regulation of nuclease activity • обмін речовин • GO:0100026 Репарація ДНК • base-excision repair Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	79661	72774
Ensembl	ENSG00000140398	ENSMUSG00000032298
UniProt	Q96FI4	Q8K4Q6
RefSeq (мРНК)	NM_001256552 NM_024608 NM_001352519 NM_001352520	NM_028347 NM_001357409
RefSeq (білок)	NP_001243481 NP_078884 NP_001339448 NP_001339449	NP_082623 NP_001344338
Локус (UCSC)	Хр. 15: 75.35 – 75.36 Mb	Хр. 9: 57.05 – 57.06 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

NEIL1 (англ. Nei like DNA glycosylase 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 15-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 390 амінокислот, а молекулярна маса — 43 684.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MPEGPELHLA		SQFVNEACRA		LVFGGCVEKS		SVSRNPEVPF		ESSAYRISAS
ARGKELRLIL		SPLPGAQPQQ		EPLALVFRFG		MSGSFQLVPR		EELPRHAHLR
FYTAPPGPRL		ALCFVDIRRF		GRWDLGGKWQ		PGRGPCVLQE		YQQFRENVLR
NLADKAFDRP		ICEALLDQRF		FNGIGNYLRA		EILYRLKIPP		FEKARSVLEA
LQQHRPSPEL		TLSQKIRTKL		QNPDLLELCH		SVPKEVVQLG		GKGYGSESGE
EDFAAFRAWL		RCYGMPGMSS		LQDRHGRTIW		FQGDPGPLAP		KGRKSRKKKS
KATQLSPEDR		VEDALPPSKA		PSRTRRAKRD		LPKRTATQRP		EGTSLQQDPE
APTVPKKGRR		KGRQAASGHC		RPRKVKADIP		SLEPEGTSAS

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до ліаз, гідролаз, глікозидаз. Задіяний у таких біологічних процесах, як пошкодження ДНК, репарація ДНК. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у цитоплазмі, цитоскелеті, ядрі, хромосомах.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Bandaru V., Sunkara S., Wallace S.S., Bond J.P. (2002). A novel human DNA glycosylase that removes oxidative DNA damage and is homologous to Escherichia coli endonuclease VIII. DNA Repair. 1: 517—529. PMID 12509226 DOI:10.1016/S1568-7864(02)00036-8
• Dou H., Mitra S., Hazra T.K. (2003). Repair of oxidized bases in DNA bubble structures by human DNA glycosylases NEIL1 and NEIL2. J. Biol. Chem. 278: 49679—49684. PMID 14522990 DOI:10.1074/jbc.M308658200
• Hildrestrand G.A., Rolseth V., Bjoras M., Luna L. (2007). Human NEIL1 localizes with the centrosomes and condensed chromosomes during mitosis. DNA Repair. 6: 1425—1433. PMID 17556049 DOI:10.1016/j.dnarep.2007.04.008
• Yeo J., Goodman R.A., Schirle N.T., David S.S., Beal P.A. (2010). RNA editing changes the lesion specificity for the DNA repair enzyme NEIL1. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 107: 20715—20719. PMID 21068368 DOI:10.1073/pnas.1009231107
• Doublie S., Bandaru V., Bond J.P., Wallace S.S. (2004). The crystal structure of human endonuclease VIII-like 1 (NEIL1) reveals a zincless finger motif required for glycosylase activity. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 101: 10284—10289. PMID 15232006 DOI:10.1073/pnas.0402051101

Див. також

• Хромосома 15