TSEN15

TSEN15
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2GW6
Ідентифікатори
Символи	TSEN15, C1orf19, sen15, tRNA splicing endonuclease subunit 15, PCH2F
Зовнішні ІД	OMIM: 608756 MGI: 1913887 HomoloGene: 12002 GeneCards: TSEN15
Онтологія гена Молекулярна функція • tRNA-intron endonuclease activity • nucleic acid binding • nuclease activity Клітинна компонента • ядерце • клітинне ядро • нуклеоплазма Біологічний процес • mRNA processing • RNA phosphodiester bond hydrolysis • RNA phosphodiester bond hydrolysis, endonucleolytic • tRNA processing • tRNA splicing, via endonucleolytic cleavage and ligation • nucleic acid phosphodiester bond hydrolysis Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	116461	66637
Ensembl	ENSG00000198860	ENSMUSG00000014980
UniProt	Q8WW01	Q8R3W5
RefSeq (мРНК)	NM_001127394 NM_001300764 NM_001300766 NM_052965 NM_001363643	NM_025677
RefSeq (білок)	NP_001120866 NP_001287693 NP_001287695 NP_443197 NP_001350572	NP_079953
Локус (UCSC)	Хр. 1: 184.05 – 184.12 Mb	Хр. 1: 152.25 – 152.26 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

TSEN15 (англ. TRNA splicing endonuclease subunit 15) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 171 амінокислот, а молекулярна маса — 18 641.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MEERGDSEPT		PGCSGLGPGG		VRGFGDGGGA		PSWAPEDAWM		GTHPKYLEMM
ELDIGDATQV		YVAFLVYLDL		MESKSWHEVN		CVGLPELQLI		CLVGTEIEGE
GLQTVVPTPI		TASLSHNRIR		EILKASRKLQ		GDPDLPMSFT		LAIVESDSTI
VYYKLTDGFM		LPDPQNISLR		R

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як процесінг мРНК, процесинг тРНК, поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Локалізований у ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Paushkin S.V., Patel M., Furia B.S., Peltz S.W., Trotta C.R. (2004). Identification of a human endonuclease complex reveals a link between tRNA splicing and pre-mRNA 3' end formation. Cell. 117: 311—321. PMID 15109492 DOI:10.1016/S0092-8674(04)00342-3
• Song J., Markley J.L. (2007). Three-dimensional structure determined for a subunit of human tRNA splicing endonuclease (Sen15) reveals a novel dimeric fold. J. Mol. Biol. 366: 155—164. PMID 17166513 DOI:10.1016/j.jmb.2006.11.024

Див. також

• Хромосома 1