TSEN2

TSEN2
Ідентифікатори
Символи	TSEN2, PCH2B, SEN2, SEN2L, tRNA splicing endonuclease subunit 2
Зовнішні ІД	OMIM: 608753 MGI: 2141599 HomoloGene: 41622 GeneCards: TSEN2
Пов'язані генетичні захворювання
рак простати, pontocerebellar hypoplasia type 2B, pontocerebellar hypoplasia type 2
Онтологія гена Молекулярна функція • tRNA-intron endonuclease activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • lyase activity • nucleic acid binding • nuclease activity Клітинна компонента • центросома • ядерце • клітинне ядро • tRNA-intron endonuclease complex • нуклеоплазма • гіалоплазма Біологічний процес • mRNA processing • tRNA-type intron splice site recognition and cleavage • RNA phosphodiester bond hydrolysis, endonucleolytic • tRNA splicing, via endonucleolytic cleavage and ligation • RNA phosphodiester bond hydrolysis • tRNA processing • nucleic acid phosphodiester bond hydrolysis Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	80746	381802
Ensembl	ENSG00000154743	ENSMUSG00000042389
UniProt	Q8NCE0	Q6P7W5
RefSeq (мРНК)	NM_001145392 NM_001145393 NM_001145394 NM_001145395 NM_025265 NM_001321277 NM_001321278 NM_001321279	NM_199033
RefSeq (білок)	NP_001138864 NP_001138865 NP_001138866 NP_001308206 NP_001308207 NP_001308208 NP_079541	NP_950198
Локус (UCSC)	Хр. 3: 12.48 – 12.54 Mb	Хр. 6: 115.52 – 115.56 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

TSEN2 (англ. TRNA splicing endonuclease subunit 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 3-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 465 амінокислот, а молекулярна маса — 53 247.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MAEAVFHAPK		RKRRVYETYE		SPLPIPFGQD		HGPLKEFKIF		RAEMINNNVI
VRNAEDIEQL		YGKGYFGKGI		LSRSRPSFTI		SDPKLVAKWK		DMKTNMPIIT
SKRYQHSVEW		AAELMRRQGQ		DESTVRRILK		DYTKPLEHPP		VKRNEEAQVH
DKLNSGMVSN		MEGTAGGERP		SVVNGDSGKS		GGVGDPREPL		GCLQEGSGCH
PTTESFEKSV		REDASPLPHV		CCCKQDALIL		QRGLHHEDGS		QHIGLLHPGD
RGPDHEYVLV		EEAECAMSER		EAAPNEELVQ		RNRLICRRNP		YRIFEYLQLS
LEEAFFLVYA		LGCLSIYYEK		EPLTIVKLWK		AFTVVQPTFR		TTYMAYHYFR
SKGWVPKVGL		KYGTDLLLYR		KGPPFYHASY		SVIIELVDDH		FEGSLRRPLS
WKSLAALSRV		SVNVSKELML		CYLIKPSTMT		DKEMESPECM		KRIKVQEVIL
SRWVSSRERS		DQDDL

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до ліаз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як процесінг мРНК, процесинг тРНК, поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Локалізований у ядрі.

Література

• Paushkin S.V., Patel M., Furia B.S., Peltz S.W., Trotta C.R. (2004). Identification of a human endonuclease complex reveals a link between tRNA splicing and pre-mRNA 3' end formation. Cell. 117: 311—321. PMID 15109492 DOI:10.1016/S0092-8674(04)00342-3
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 3