TSEN34

TSEN34
Ідентифікатори
Символи	TSEN34, LENG5, PCH2C, SEN34, SEN34L, tRNA splicing endonuclease subunit 34
Зовнішні ІД	OMIM: 608754 MGI: 1913328 HomoloGene: 44182 GeneCards: TSEN34
Пов'язані генетичні захворювання
pontocerebellar hypoplasia type 2C
Онтологія гена Молекулярна функція • tRNA-intron endonuclease activity • lyase activity • nucleic acid binding • nuclease activity Клітинна компонента • ядерце • клітинне ядро • tRNA-intron endonuclease complex • нуклеоплазма Біологічний процес • mRNA processing • tRNA-type intron splice site recognition and cleavage • RNA phosphodiester bond hydrolysis, endonucleolytic • tRNA splicing, via endonucleolytic cleavage and ligation • RNA phosphodiester bond hydrolysis • tRNA processing • nucleic acid phosphodiester bond hydrolysis Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	79042	66078
Ensembl	ENSG00000278622 ENSG00000274129 ENSG00000274796 ENSG00000278712 ENSG00000275165 ENSG00000278605 ENSG00000273896 ENSG00000274078 ENSG00000274672 ENSG00000170892	ENSMUSG00000035585
UniProt	Q9BSV6	Q8BMZ5
RefSeq (мРНК)	NM_001077446 NM_001282332 NM_001282333 NM_024075 NM_001386740	NM_001164204 NM_001164205 NM_024168
RefSeq (білок)	NP_001070914 NP_001269261 NP_001269262 NP_076980	NP_001157676 NP_001157677 NP_077130
Локус (UCSC)	Хр. 19: 54.19 – 54.19 Mb	Хр. 7: 3.7 – 3.7 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

TSEN34 (англ. TRNA splicing endonuclease subunit 34) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 19-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 310 амінокислот, а молекулярна маса — 33 652.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MLVVEVANGR		SLVWGAEAVQ		ALRERLGVGG		RTVGALPRGP		RQNSRLGLPL
LLMPEEARLL		AEIGAVTLVS		APRPDSRHHS		LALTSFKRQQ		EESFQEQSAL
AAEARETRRQ		ELLEKITEGQ		AAKKQKLEQA		SGASSSQEAG		SSQAAKEDET
SDGQASGEQE		EAGPSSSQAG		PSNGVAPLPR		SALLVQLATA		RPRPVKARPL
DWRVQSKDWP		HAGRPAHELR		YSIYRDLWER		GFFLSAAGKF		GGDFLVYPGD
PLRFHAHYIA		QCWAPEDTIP		LQDLVAAGRL		GTSVRKTLLL		CSPQPDGKVV
YTSLQWASLQ

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до ліаз. Задіяний у таких біологічних процесах, як процесинг мРНК, процесинг тРНК. Локалізований у ядрі.

Література

• Paushkin S.V., Patel M., Furia B.S., Peltz S.W., Trotta C.R. (2004). Identification of a human endonuclease complex reveals a link between tRNA splicing and pre-mRNA 3' end formation. Cell. 117: 311—321. PMID 15109492 DOI:10.1016/S0092-8674(04)00342-3
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Wende H., Volz A., Ziegler A. (2000). Extensive gene duplications and a large inversion characterize the human leukocyte receptor cluster. Immunogenetics. 51: 703—713. PMID 10941842 DOI:10.1007/s002510000187
• Wende H., Volz A., Ziegler A. (2001). Immunogenetics. 52: 3—4. {{cite journal}}: Пропущений або порожній |title= (довідка)

Див. також

• Хромосома 19