У дорослому футболі дебютував 2009 року виступами за команду клубу «Реал Сосьєдад Б», в якій провів два сезони, взявши участь у 54 матчах чемпіонату. Більшість часу, проведеного у складі другої команди «Реал Сосьєдада», був основним гравцем захисту команди.
До складу дорослої команди приєднався 2011 року.Де грав 6,5 років.В січні 2018 року перейшов до стану принципових суперників «Реал Сосьєдада»«Атлетика» з Більбао. Влітку 2023 Іньїго Мартінес на правах вільного агента став гравцем «Барселони»[1].