Територія Мюнхендорфа була вже в епоху неоліту (близько 5000-2000 років до н.е.) заселений. За ним послідували поселення кельтів, потім римлян. За останнього територія належала до провінції Паннонія Верхня. На поточній трасі федеральної траси Айзенштадт (Оденбург Штрассе) Б 16 імовірно була дорога на Шопрон.