Хітиназа
Хітинази (КФ 3.2.1.14) — ферменти, що каталізують деградацію хітину, і що діють найчастіше як ендоферменти, відщеплюючи хітоолігосахариди довжиною в 2 — 6 N-ацетилглюкозамінових залишків[1]. Хитінази належать до групи О-глікозидних гідролаз, що руйнують глікозидний зв'язок між двома або більш вуглеводневими залишками або між вуглеводним і невуглеводним компонентом. Такі гідролази об'єднані в сімейства залежно від їх амінокислотної послідовності. Зараз відомо 110 сімейств цих ферментів[2], більшість хітиназ належать до сімейств GH18 і GH19[3], одна (що належить комасі ряду жорсткокрилих, Gastrophysa atrocyanea) — до сімейства GH48. Їх найважливіші властивості представлені в таблиці 1.
Всі організми, що містять хітин, продукують хитінази, які, ймовірно, необхідні їм для морфогенезу клітинної стінки або екзоскелету[3].Багато видів бактерій родів Bacillus, Pseudomonas і Streptomyces за рахунок секреції хітиназ здатні використовувати хітин як єдине джерело вуглецю[4][5][6]. Крім того, продукція хітиназ багатьма організмами є важливим захисним фактором проти дії різних патогенів. Хітинази належать до класу PR-3-білків[3]. Відповідно до їх амінокислотної послідовності, PR-3 — білки, у свою чергу, підрозділяються на чотири класи. Хітинази класу I містять хітин-зв'язуючий гевеїноподібний домен і висококонсервативний центральний регіон, відокремлений від гевеїнового домену шарнірною делянкою. Хітинази класу II схожі з хітиназами класу I, але гевеїновий домен у них відсутній. Хітинази класу III не виявляють значущої гомології з хітиназамі інших класів. Хитінази класу IV схожі з хітиназамі класу I, але значні консервативні області у ферментів даного класу відсутні.
Характеристики | Хітинази семейства GH18 | Хітинази семейства GH19 | Хітинази семейства GH48[7] |
---|---|---|---|
Приналежність сімейства до клану гликозил-гідролаз | GH-K | близькі до GH-I | GH-M |
Розповсюдження | Хітинази бактерій, грибів, вірусів, тварин, хітинази рослин класів III і IV | Хітинази рослин класів I, II і IV, хітинази Streptomyces | Хитиназа, що належить комахі Gastrophysa atrocyanea |
Структура каталітичного домену | (β/α)8-барель | Лізоцимовий тип (α+β) | (α/α)6 |
Гідроліз глікозидних зв'язків | Із збереженням конформації[8] | З інверсією конформації[9] | З інверсією конформації |
Зв'язок, що розривається | GlcNAc-GlcNAc і GlcNAc-GlcN [9] | GlcNAc-GlcNAc і GlcN-GlcNAc [10] | — |
Чутливість до інгібіторів | Чутливі до аллозамідину [11] | Нечутливі до аллозамідину | — |
- ↑ Stintzi A., Heitz T., Prasad V., Wiedemann-Merdinoglu S., Kauffmann S., Goeffroy P. та ін. (1993). Plant pathogenesis-related proteins and their role in defense against pathogens. Biochimie. 75: 687—706. PMID 8286442.
{{cite journal}}
: Явне використання «та ін.» у:|author=
(довідка) - ↑ CAZy - Carbohydrate-Active enZymes. Архів оригіналу за 26 червня 2013. Процитовано 13 лютого 2008. [Архівовано 2013-09-27 у Wayback Machine.]
- ↑ а б в Theis T., Stahl U (2004). Antifungal proteins: targets, mechanisms and prospective applications. Cell. and Mol. Life Sciences. 61: 437—455. PMID 14999404.
- ↑ Wang S. L., Chang W. T (1997). Purification and characterization of two bifunctional chitinase/lysozymes extracellulary produced by Pseudomonas aeruginosa K-187 in a shrimp and crab shell powder medium. Appl. Environ. Microbiol. 63: 380—386. PMID 9023918.
- ↑ Watanabe T., Kanai R., Kawase T., Tanabe T., Mitsutomi M., Sakuda S. та ін. (1999). Family 19 chitinases of Streptomyces species: characterization and distribution. Microbiology. 145: 3353—3363. PMID 10627034.
{{cite journal}}
: Явне використання «та ін.» у:|author=
(довідка) - ↑ Wang S. L., Shih I. L., Liang T. W., Wang C. H. (2002). Purification and characterization of two antifungal chitinases produced by the Bacillus amyloliquefaciens V656 in а shrimp and crab shell powder medium. J. Agric. Food Chem. 50: 2241—2248. PMID 11929278.
- ↑ Fujita K., Shimomura K., Yamamoto K., Yamashita T., Suzuki K. (2006). A chitinase structurally related to the glycoside hydrolase family 48 is indispensable for the hormonally induced diapause termination in a beetle. Biochem Biophys Res Commun. 345 (1): 502—507. PMID 16684504.
- ↑ Iseli B., Boller T., Neuhaus J. M. (1993). The N-terminal cysteine-rich domain of tobacco class I chitinase is essential for chitin binding but not for catalytic or antifungal activity. Plant Physiol. 103: 221—226. PMID 8208848.
- ↑ а б Ohno T., Armand S., Hata T., Nikaidou N., Henrissat B., Mitsutomi M. та ін. (1996). A modular family 19 chitinase found in the prokaryotic organism Streptomyces griseus HUT 6. J. Bacteriology. 178: 5065—5070. PMID 8752320.
{{cite journal}}
: Явне використання «та ін.» у:|author=
(довідка) - ↑ Mitsutomi M., Ueda M., Arai M., Ando A., Watanabe T. (1996). Action pattern of microbial chitinases on partially N-acetylated chitosan. Chitin Enzymol. 2: 273—284. PMID 1368549.
- ↑ Koga D., Isogai A., Sakuda S., Matsumoto S., Suzuki A., Kimura S. (1987). Specific inhibition of Bombyx mori chitinase by allosamidin. Agric. Biol. Chem. 51: 471—476.
Це незавершена стаття з біохімії. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |