Дермсідин

Дермсідин
Наявні структури PDB Пошук для людей: PDBe RCSB Список кодів PDB 2YMK, 2KSG
Ідентифікатори
Символи	DCD, AIDD, DCD-1, DSEP, HCAP, PIF, dermcidin
Зовнішні ІД	OMIM: 606634 HomoloGene: 89039 GeneCards: DCD
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0070122 peptidase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • hydrolase activity • RNA binding Клітинна компонента • екзосома • GO:0005578 Позаклітинна матриця • extracellular region • міжклітинний простір Біологічний процес • defense response to bacterium • протеоліз • antimicrobial humoral response • antimicrobial humoral immune response mediated by antimicrobial peptide • killing of cells of other organism • defense response to fungus Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	117159	н/д
Ensembl	ENSG00000161634	н/д
UniProt	P81605	н/д
RefSeq (мРНК)	NM_053283 NM_001300854	н/д
RefSeq (білок)	NP_001287783 NP_444513	н/д
Локус (UCSC)	Хр. 12: 54.64 – 54.65 Mb	н/д
PubMed search		н/д
Вікідані
Див./Ред. для людей

Дермсідин (англ. Dermcidin) – білок, який кодується геном DCD, розташованим у людей на короткому плечі 12-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 110 амінокислот, а молекулярна маса — 11 284.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MRFMTLLFLT		ALAGALVCAY		DPEAASAPGS		GNPCHEASAA		QKENAGEDPG
LARQAPKPRK		QRSSLLEKGL		DGAKKAVGGL		GKLGKDAVED		LESVGKGAVH
DVKDVLDSVL

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін

Y: Тирозин

Цей білок за функціями належить до гідролаз, протеаз, антибіотиків, антимікробних білків, фунгіцидів. Білок має сайт для зв'язування з іоном марганцю. Секретований назовні.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Zhang Z., Henzel W.J. (2004). Signal peptide prediction based on analysis of experimentally verified cleavage sites. Protein Sci. 13: 2819—2824. PMID 15340161 DOI:10.1110/ps.04682504

Див. також

• Хромосома 12