Аргініл-тРНК-синтаза

Аргініл-тРНК-синтаза
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 4Q2T, 4Q2X, 4Q2Y, 4R3Z, 4ZAJ
Ідентифікатори
Символи	RARS1, ArgRS, DALRD1, HLD9, arginyl-tRNA synthetase, arginyl-tRNA synthetase 1, RARS
Зовнішні ІД	OMIM: 107820 MGI: 1914297 HomoloGene: 68281 GeneCards: RARS1
Пов'язані генетичні захворювання
hypomyelinating leukodystrophy 9
Онтологія гена Молекулярна функція • aminoacyl-tRNA ligase activity • nucleotide binding • tRNA binding • arginine binding • ligase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • ATP binding • cadherin binding • arginine-tRNA ligase activity Клітинна компонента • мембрана • нуклеоплазма • мітохондрія • екзосома • клітинне ядро • цитоплазма • aminoacyl-tRNA synthetase multienzyme complex • гіалоплазма Біологічний процес • Біосинтез білків • tRNA aminoacylation for protein translation • arginyl-tRNA aminoacylation Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	5917	104458
Ensembl	ENSG00000113643	ENSMUSG00000018848
UniProt	P54136	Q9D0I9
RefSeq (мРНК)	NM_002887	NM_025936
RefSeq (білок)	NP_002878	NP_080212
Локус (UCSC)	Хр. 5: 168.49 – 168.52 Mb	Хр. 11: 35.7 – 35.73 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Аргініл-тРНК-синтаза (англ. Arginyl-tRNA synthetase) – білок, який кодується геном RARS, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 660 амінокислот, а молекулярна маса — 75 379.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MDVLVSECSA		RLLQQEEEIK		SLTAEIDRLK		NCGCLGASPN		LEQLQEENLK
LKYRLNILRK		SLQAERNKPT		KNMINIISRL		QEVFGHAIKA		AYPDLENPPL
LVTPSQQAKF		GDYQCNSAMG		ISQMLKTKEQ		KVNPREIAEN		ITKHLPDNEC
IEKVEIAGPG		FINVHLRKDF		VSEQLTSLLV		NGVQLPALGE		NKKVIVDFSS
PNIAKEMHVG		HLRSTIIGES		ISRLFEFAGY		DVLRLNHVGD		WGTQFGMLIA
HLQDKFPDYL		TVSPPIGDLQ		VFYKESKKRF		DTEEEFKKRA		YQCVVLLQGK
NPDITKAWKL		ICDVSRQELN		KIYDALDVSL		IERGESFYQD		RMNDIVKEFE
DRGFVQVDDG		RKIVFVPGCS		IPLTIVKSDG		GYTYDTSDLA		AIKQRLFEEK
ADMIIYVVDN		GQSVHFQTIF		AAAQMIGWYD		PKVTRVFHAG		FGVVLGEDKK
KFKTRSGETV		RLMDLLGEGL		KRSMDKLKEK		ERDKVLTAEE		LNAAQTSVAY
GCIKYADLSH		NRLNDYIFSF		DKMLDDRGNT		AAYLLYAFTR		IRSIARLANI
DEEMLQKAAR		ETKILLDHEK		EWKLGRCILR		FPEILQKILD		DLFLHTLCDY
IYELATAFTE		FYDSCYCVEK		DRQTGKILKV		NMWRMLLCEA		VAAVMAKGFD
ILGIKPVQRM

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Цей білок за функціями належить до лігаз, аміноацил-тРНК-синтетаз. Задіяний у такому біологічному процесі як біосинтез білка. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами. Локалізований у цитоплазмі.

Література

• Girjes A.A., Hobson K., Chen P., Lavin M.F. (1995). Cloning and characterization of cDNA encoding a human arginyl-tRNA synthetase. Gene. 164: 347—350. PMID 7590355 doi:10.1016/0378-1119(95)00502-W
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
• Zheng Y.-G., Wei H., Ling C., Xu M.-G., Wang E.-D. (2006). Two forms of human cytoplasmic arginyl-tRNA synthetase produced from two translation initiations by a single mRNA. Biochemistry. 45: 1338—1344. PMID 16430231 doi:10.1021/bi051675n

Див. також

• Хромосома 5