Гістондеацетилаза-5

HDAC5
Ідентифікатори
Символи	HDAC5, HD5, NY-CO-9, histone deacetylase 5
Зовнішні ІД	OMIM: 605315 MGI: 1333784 HomoloGene: 3995 GeneCards: HDAC5
Реагує на сполуку
belinostat, givinostat, pracinostat, quisinostat, romidepsin, trichostatin A, золінза
Онтологія гена Молекулярна функція • NAD-dependent histone deacetylase activity (H3-K14 specific) • protein deacetylase activity • histone deacetylase binding • chromatin binding • зв'язування з іоном металу • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • hydrolase activity • protein kinase C binding • histone deacetylase activity • transcription factor binding • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding Клітинна компонента • комплекс Ґольджі • histone deacetylase complex • цитоплазма • клітинне ядро • нуклеоплазма • гіалоплазма • nuclear speck • GO:0009327 protein-containing complex Біологічний процес • histone H3 deacetylation • ремоделювання хроматину • regulation of myotube differentiation • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • Епігенетичне успадкування • positive regulation of DNA-binding transcription factor activity • regulation of histone H3-K9 acetylation • response to activity • transcription, DNA-templated • protein deacetylation • negative regulation of cell migration involved in sprouting angiogenesis • B cell activation • neuron differentiation • negative regulation of myotube differentiation • cellular response to insulin stimulus • B cell differentiation • inflammatory response • regulation of protein binding • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • cellular response to lipopolysaccharide • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • response to cocaine • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • histone deacetylation • GO:0031497, GO:0006336, GO:0034724, GO:0001301, GO:0007580, GO:0034652, GO:0010847 chromatin organization Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	10014	15184
Ensembl	ENSG00000108840	ENSMUSG00000008855
UniProt	Q9UQL6	Q9Z2V6
RefSeq (мРНК)	NM_001015053 NM_005474 NM_139205 NM_001382393	NM_001077696 NM_001284248 NM_001284249 NM_001284250 NM_010412 NM_001361596
RefSeq (білок)	NP_001015053 NP_005465 NP_001369322	н/д
Локус (UCSC)	Хр. 17: 44.08 – 44.12 Mb	Хр. 11: 102.19 – 102.23 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Гістондеацетилаза-5 (англ. Histone deacetylase 5) — білок, який кодується геном HDAC5, розташованим у людей на короткому плечі 17-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 122 амінокислот, а молекулярна маса — 121 978.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MNSPNESDGM		SGREPSLEIL		PRTSLHSIPV		TVEVKPVLPR		AMPSSMGGGG
GGSPSPVELR		GALVGSVDPT		LREQQLQQEL		LALKQQQQLQ		KQLLFAEFQK
QHDHLTRQHE		VQLQKHLKQQ		QEMLAAKQQQ		EMLAAKRQQE		LEQQRQREQQ
RQEELEKQRL		EQQLLILRNK		EKSKESAIAS		TEVKLRLQEF		LLSKSKEPTP
GGLNHSLPQH		PKCWGAHHAS		LDQSSPPQSG		PPGTPPSYKL		PLPGPYDSRD
DFPLRKTASE		PNLKVRSRLK		QKVAERRSSP		LLRRKDGTVI		STFKKRAVEI
TGAGPGASSV		CNSAPGSGPS		SPNSSHSTIA		ENGFTGSVPN		IPTEMLPQHR
ALPLDSSPNQ		FSLYTSPSLP		NISLGLQATV		TVTNSHLTAS		PKLSTQQEAE
RQALQSLRQG		GTLTGKFMST		SSIPGCLLGV		ALEGDGSPHG		HASLLQHVLL
LEQARQQSTL		IAVPLHGQSP		LVTGERVATS		MRTVGKLPRH		RPLSRTQSSP
LPQSPQALQQ		LVMQQQHQQF		LEKQKQQQLQ		LGKILTKTGE		LPRQPTTHPE
ETEEELTEQQ		EVLLGEGALT		MPREGSTESE		STQEDLEEED		EEDDGEEEED
CIQVKDEEGE		SGAEEGPDLE		EPGAGYKKLF		SDAQPLQPLQ		VYQAPLSLAT
VPHQALGRTQ		SSPAAPGGMK		SPPDQPVKHL		FTTGVVYDTF		MLKHQCMCGN
THVHPEHAGR		IQSIWSRLQE		TGLLSKCERI		RGRKATLDEI		QTVHSEYHTL
LYGTSPLNRQ		KLDSKKLLGP		ISQKMYAVLP		CGGIGVDSDT		VWNEMHSSSA
VRMAVGCLLE		LAFKVAAGEL		KNGFAIIRPP		GHHAEESTAM		GFCFFNSVAI
TAKLLQQKLN		VGKVLIVDWD		IHHGNGTQQA		FYNDPSVLYI		SLHRYDNGNF
FPGSGAPEEV		GGGPGVGYNV		NVAWTGGVDP		PIGDVEYLTA		FRTVVMPIAH
EFSPDVVLVS		AGFDAVEGHL		SPLGGYSVTA		RCFGHLTRQL		MTLAGGRVVL
ALEGGHDLTA		ICDASEACVS		ALLSVELQPL		DEAVLQQKPN		INAVATLEKV
IEIQSKHWSC		VQKFAAGLGR		SLREAQAGET		EEAETVSAMA		LLSVGAEQAQ
AAAAREHSPR		PAEEPMEQEP		AL

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, гідролаз, регуляторів хроматину, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

• Grozinger C.M., Hassig C.A., Schreiber S.L. (1999). Three proteins define a class of human histone deacetylases related to yeast Hda1p. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 96: 4868—4873. PMID 10220385 DOI:10.1073/pnas.96.9.4868
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• McKinsey T.A., Zhang C.-L., Lu J., Olson E.N. (2000). Signal-dependent nuclear export of a histone deacetylase regulates muscle differentiation. Nature. 408: 106—111. PMID 11081517 DOI:10.1038/35040593
• McKinsey T.A., Zhang C.-L., Olson E.N. (2000). Activation of the myocyte enhancer factor-2 transcription factor by calcium/calmodulin-dependent protein kinase-stimulated binding of 14-3-3 to histone deacetylase 5. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 97: 14400—14405. PMID 11114197 DOI:10.1073/pnas.260501497
• McKinsey T.A., Zhang C.-L., Olson E.N. (2001). Identification of a signal-responsive nuclear export sequence in class II histone deacetylases. Mol. Cell. Biol. 21: 6312—6321. PMID 11509672 DOI:10.1128/MCB.21.18.6312-6321.2001
• Hook S.S., Orian A., Cowley S.M., Eisenman R.N. (2002). Histone deacetylase 6 binds polyubiquitin through its zinc finger (PAZ domain) and copurifies with deubiquitinating enzymes. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 99: 13425—13430. PMID 12354939 DOI:10.1073/pnas.172511699

Див. також

• Хромосома 17