Замілон

Матеріал з Вікіпедії — вільної енциклопедії.
Перейти до навігації Перейти до пошуку
Замілон
Електронна мікросвітлина вірусної фабрики в клітці амеби, інфікованої Замілоном і Mont1 одночасно. Стрілки вказують на ненормальні частки Mont1. Мірило — 0,1 мкм
Електронна мікросвітлина вірусної фабрики в клітці амеби, інфікованої Замілоном і Mont1 одночасно. Стрілки вказують на ненормальні частки Mont1. Мірило — 0,1 мкм
Біологічна класифікація
Царство: Віруси
Родина: Вірофаги (Lavidaviridae)
Рід: Sputnikvirus
Вид: Замілон
Синоніми
за даними NCBI[1]:
  • Zamilon virophage
  • Zamilon virus
Посилання
Вікісховище: Mimivirus-dependent virus Zamilon
Віківиди: Mimivirus-dependent virus Zamilon
EOL: 46701010
ICTV: 20162994
NCBI: 1411887

Заміло́н[2] (англ. Mimivirus-dependent virus Zamilon, раніше Zamilon virophage) — вірофаг-сателіт, що вражає амебу Acanthamoeba polyphaga. Було виділено 2013 року в Тунісі зі зразка ґрунту разом з гігантським вірусом Mont1[3][4][5]. Слово «замілон» в перекладі з ар. — «сусід». 2015 року в Північній Америці було описано близький до Замілону вірофаг, який отримав назву «Замілон 2»[6].

Таксономія

[ред. | ред. код]

Міжнародний комітет з таксономії вірусів (ICTV) виділяє цей вірус в окремий вид роду Sputnikvirus родини Lavidaviridae[3].

Структура і геном

[ред. | ред. код]

Замілон є сферичною частинкою діаметром 50–60 нм і зовні схожий на інші вірофаги, а саме Супутник[ru] і мавірус. Геном Замілона — це кільцева[en] молекула ДНК довжиною 17 276 пар основ (п. о.) з низьким GC-вмістом (29,7%), містить 20 відкритих рамок зчитування (ORF) довжиною від 222 до 2337 п. о. Геном Замілона значно відрізняється від генома Супутника: мають тотожні 76% нуклеотидів при покритті[en] генома Супутника на 75%. Проте, 17 ORF Замілона гомологічні генам Супутника, дві ORF гомологічні генам Megavirus chiliensis, і одна ORF гомологічна гену Moumouvirus monve[7]. Серед передбачених білків Замілона вдалося ідентифікувати транспозазу, хеліказу, інтегразу, цистеїнову протеазу, ДНК-праймазу-полімеразу, а також АТФази, що упаковують ДНК к віріони, мажорні та малі білки капсида, структурний білок і колаген-подібний білок. Продукт шостий ORF дуже схожий на мажорний білок капсида Супутника, який містить своєрідний структурний мотив «jelly-roll fold[en]»[4][8].

Життєвий цикл

[ред. | ред. код]
Електронна мікросвітлина вірусної фабрики в клітці амеби, одночасно зараженої Замілоном і вірусом Mont1. Мірило — 0,1 мкм

Як і в інших вірофагів, реплікація геному Замілона протікає в цитоплазмі клітини-господаря, точніше, у вірусній фабриці вірусу-господаря. Спочатку Замілон було виділено разом зі штамом Mont1, що входить до родини Mimiviridae. Згодом було показано, що вірусами-господарями для Замілона можуть виступати штами Moumouvirus, Monve, Terra1 і Courdo11, що також входять у родину Mimiviridae, але не мамавірус[en] и мімівірус[9]. У цьому відношенні Замілон відрізняється від Супутника, вірусом-господарем якого може виступати будь-який член родини Mimiviridae[4].

Мабуть, Замілон не вчинює сильну гнітючу дію на розмноження вірусу-господаря і його здатність викликати лізис клітин амеб-господарів. Хоча в присутності Замілона у вірусу-господаря спостерігається висока частка дефектних віріонів, подібне часто спостерігається і під час відсутності вірофагу. Цим Замілон також відрізняється від Супутника, який знижує інфективність вірусу-господаря і пригнічує лізис заражених клітин[4].

2016 року з'явилося повідомлення про виявлення у мімівірусу групи А механізму, відповідального за стійкість до вірофагу Замілон. Ключовим складником цього механізму є генетична система MIMIvirus VIrophage Resistant Element (MIMIVIRE), що містить кілька вставок, відповідних послідовностей з генома Замілона. Було висловлено припущення, що система на основі MIMIVIRE працює подібно системам CRISPR/Cas, що забезпечує захист від вірусів у бактерій та архей: зі вставок в геномі мімівірусв синтезуються РНК, які комплементарно зв'язуються з геномами вірофагу, приводячи до їхнього знищення[10]. На користь цього висновку говорять дані досліджень з відключення MIMIVIRE. Однак у цієї гіпотези існує ряд проблем. Неясно, наприклад, яким чином система MIMIVIRE відрізняє вставки з генома вірофагу в геном мімівірусу від таких же послідовностей в геномі вірофагу і уникає руйнування генома самого мімівірусу. Запропоновано альтернативний механізм роботи MIMIVIRE, в основі якого лежать не комплементарні взаємодії нуклеїнових кислот, а білок-білкові взаємодії[11].

Примітки

[ред. | ред. код]
  1. Zamilon virus у Національному центрі біотехнологічної інформації(англ.)п.
  2. (рос.) Кирилл Стасевич. У гигантских вирусов нашли бактериальную «иммунную систему» // Наука и жизнь. — 2016.
  3. а б PMID 26446887 (PMID 26446887)
    Бібліографічний опис з'явиться автоматично через деякий час. Ви можете підставити цитату власноруч або використовуючи бота.
  4. а б в г PMID 24747414 (PMID 24747414)
    Бібліографічний опис з'явиться автоматично через деякий час. Ви можете підставити цитату власноруч або використовуючи бота.
  5. (англ.) Boughalmi M, Saadi H, Pagnier I, Colson P, Fournous G, Raoult D, La Scola B (2013), High-throughput isolation of giant viruses of the Mimiviridae and Marseilleviridae families in the Tunisian environment, Environmental Microbiology, 15: :2000–7, doi:10.1111/1462-2920.12068, PMID 23298151
  6. PMID 26640459 (PMID 26640459)
    Бібліографічний опис з'явиться автоматично через деякий час. Ви можете підставити цитату власноруч або використовуючи бота.
  7. PMID 27886075 (PMID 27886075)
    Бібліографічний опис з'явиться автоматично через деякий час. Ви можете підставити цитату власноруч або використовуючи бота.
  8. PMID 23091035 (PMID 23091035)
    Бібліографічний опис з'явиться автоматично через деякий час. Ви можете підставити цитату власноруч або використовуючи бота.
  9. PMID 25104553 (PMID 25104553)
    Бібліографічний опис з'явиться автоматично через деякий час. Ви можете підставити цитату власноруч або використовуючи бота.
  10. PMID 26934229 (PMID 26934229)
    Бібліографічний опис з'явиться автоматично через деякий час. Ви можете підставити цитату власноруч або використовуючи бота.
  11. PMID 27315813 (PMID 27315813)
    Бібліографічний опис з'явиться автоматично через деякий час. Ви можете підставити цитату власноруч або використовуючи бота.