Перший матч збірна Фарер зіграла ще у 1930 році, але офіційними признаються матчі, починаючи з 1988 року, коли Федерація футболу Фарерських островів була прийнята до ФІФА (до УЄФА — з 1990 року). Попри те, що фактично Фарери не є незалежною державою (користуючись широкою автономією у складі Данії), збірній дозволено виступати у міжнародних змаганнях. Серед досягнень збірної Фарерських островів — дві перемоги в футбольному турнірі так званих Острівних Ігор в 1989, 1991 роках, де беруть участь різноманітні збірні, які представляють острівні частини більш крупних держав (наприклад, Гібралтар, Родос, Шетлендські острови).
Однак головним тріумфом команди вважається перемога 1:0 над збірною Австрії в дебютному для фарерців відбірковому матчі чемпіонату Європи. Історична гра відбулася 12 вересня1990 року на нейтральному полі у шведському місті Ландскруна. Єдиний гол забив півзахисник клубу «СуйФ Сандававур» Торкіл Нільсен, продавець деревини за основним родом діяльності.
Непогано фарерці виступили і в кваліфікації до ЧС-2002 — вони врятували матч зі збірною Словенії, забивши за декілька хвилин до фінального свистка 2 голи у ворота словенців; при жахливих погодних умовах змогли перемогти команду Люксембургу; довго стримували натиск збірної Росії (м'яч часто потрапляв у штангу або в перекладину і декілька разів ледве не зламав ворота).
В рамках відбору до ЧС-2010 фарерці на стадіоні в Торсхавні зіграли внічию зі збірною Австрії — 1:1 (єдиний гол у фарерців забив 20-річний півзахисник Бокі Локін) і перемогли 2:1 збірну Литви.
Збірна почергово проводить домашні матчі на стадіонах «Свангаскар» (збудований у 1991 році) в селищі Тофтір і «Торсволлюр», (збудований у 2000 році) у столиці Фарер Торсгавні.