Рибофорин I

Рибофорин I
Ідентифікатори
Символи	RPN1, OST1, RBPH1, ribophorin I
Зовнішні ІД	OMIM: 180470 MGI: 98084 HomoloGene: 2213 GeneCards: RPN1
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • dolichyl-diphosphooligosaccharide-protein glycotransferase activity • RNA binding Клітинна компонента • Меланосома • integral component of membrane • oligosaccharyltransferase complex • rough endoplasmic reticulum • endoplasmic reticulum membrane • мембрана • GO:0005578 Позаклітинна матриця • ендоплазматичний ретикулум • гіалоплазма Біологічний процес • GO:0033578, GO:0033577, GO:0033575, GO:0033576 protein glycosylation • protein N-linked glycosylation via asparagine Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	6184	103963
Ensembl	ENSG00000163902	ENSMUSG00000030062
UniProt	P04843	Q91YQ5
RefSeq (мРНК)	NM_002950	NM_133933
RefSeq (білок)	NP_002941	NP_598694
Локус (UCSC)	Хр. 3: 128.62 – 128.68 Mb	Хр. 6: 88.06 – 88.08 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Рибофорин I (англ. Ribophorin I) – білок, який кодується геном RPN1, розташованим у людей на короткому плечі 3-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 607 амінокислот, а молекулярна маса — 68 569.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MEAPAAGLFL		LLLLGTWAPA		PGSASSEAPP		LINEDVKRTV		DLSSHLAKVT
AEVVLAHLGG		GSTSRATSFL		LALEPELEAR		LAHLGVQVKG		EDEEENNLEV
RETKIKGKSG		RFFTVKLPVA		LDPGAKISVI		VETVYTHVLH		PYPTQITQSE
KQFVVFEGNH		YFYSPYPTKT		QTMRVKLASR		NVESYTKLGN		PTRSEDLLDY
GPFRDVPAYS		QDTFKVHYEN		NSPFLTITSM		TRVIEVSHWG		NIAVEENVDL
KHTGAVLKGP		FSRYDYQRQP		DSGISSIRSF		KTILPAAAQD		VYYRDEIGNV
STSHLLILDD		SVEMEIRPRF		PLFGGWKTHY		IVGYNLPSYE		YLYNLGDQYA
LKMRFVDHVF		DEQVIDSLTV		KIILPEGAKN		IEIDSPYEIS		RAPDELHYTY
LDTFGRPVIV		AYKKNLVEQH		IQDIVVHYTF		NKVLMLQEPL		LVVAAFYILF
FTVIIYVRLD		FSITKDPAAE		ARMKVACITE		QVLTLVNKRI		GLYRHFDETV
NRYKQSRDIS		TLNSGKKSLE		TEHKALTSEI		ALLQSRLKTE		GSDLCDRVSE
MQKLDAQVKE		LVLKSAVEAE		RLVAGKLKKD		TYIENEKLIS		GKRQELVTKI
DHILDAL

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Цей білок за функціями належить до трансфераз, глікозилтрансфераз. Локалізований у мембрані, ендоплазматичному ретикулумі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
• Kelleher D.J., Karaoglu D., Mandon E.C., Gilmore R. (2003). Oligosaccharyltransferase isoforms that contain different catalytic STT3 subunits have distinct enzymatic properties. Mol. Cell. 12: 101—111. PMID 12887896 doi:10.1016/S1097-2765(03)00243-0
• Shibatani T., David L.L., McCormack A.L., Frueh K., Skach W.R. (2005). Proteomic analysis of mammalian oligosaccharyltransferase reveals multiple subcomplexes that contain Sec61, TRAP, and two potential new subunits. Biochemistry. 44: 5982—5992. PMID 15835887 doi:10.1021/bi047328f
• Impens F., Radoshevich L., Cossart P., Ribet D. (2014). Mapping of SUMO sites and analysis of SUMOylation changes induced by external stimuli. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 111: 12432—12437. PMID 25114211 doi:10.1073/pnas.1413825111
• Crimaudo C., Hortsch M., Gausepohl H., Meyer D.I. (1987). Human ribophorins I and II: the primary structure and membrane topology of two highly conserved rough endoplasmic reticulum-specific glycoproteins. EMBO J. 6: 75—82. PMID 3034581

Див. також

• Хромосома 3