Синаптофізин

SYP
Ідентифікатори
Символи	SYP, MRX96, MRXsynaptophysin, XLID96
Зовнішні ІД	OMIM: 313475 MGI: 98467 HomoloGene: 2391 GeneCards: SYP
Пов'язані генетичні захворювання
non-syndromic X-linked intellectual disability
Онтологія гена Молекулярна функція • SH2 domain binding • protein self-association • cholesterol binding • identical protein binding • syntaxin-1 binding Клітинна компонента • integral component of membrane • мембрана • Синаптичні бульбашки • синапс • excitatory synapse • synaptic vesicle membrane • presynaptic active zone • міжклітинні контакти • terminal bouton • integral component of synaptic vesicle membrane • neuron projection • neuron projection terminus • presynaptic membrane • GO:0016023 cytoplasmic vesicle • neuromuscular junction • Schaffer collateral - CA1 synapse • perinuclear region of cytoplasm Біологічний процес • cellular response to organic substance • regulation of long-term neuronal synaptic plasticity • ендоцитоз • regulation of opioid receptor signaling pathway • regulation of short-term neuronal synaptic plasticity • synaptic vesicle membrane organization • regulation of neuronal synaptic plasticity • synaptic vesicle maturation • synaptic vesicle endocytosis • regulation of synaptic vesicle exocytosis Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	6855	20977
Ensembl	ENSG00000102003	ENSMUSG00000031144
UniProt	P08247	Q62277
RefSeq (мРНК)	NM_003179	NM_009305
RefSeq (білок)	NP_003170	NP_033331
Локус (UCSC)	Хр. X: 49.19 – 49.2 Mb	Хр. X: 7.5 – 7.52 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

SYP (англ. Synaptophysin) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі X-хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 313 амінокислот, а молекулярна маса — 33 845.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MLLLADMDVV		NQLVAGGQFR		VVKEPLGFVK		VLQWVFAIFA		FATCGSYSGE
LQLSVDCANK		TESDLSIEVE		FEYPFRLHQV		YFDAPTCRGG		TTKVFLVGDY
SSSAEFFVTV		AVFAFLYSMG		ALATYIFLQN		KYRENNKGPM		LDFLATAVFA
FMWLVSSSAW		AKGLSDVKMA		TDPENIIKEM		PVCRQTGNTC		KELRDPVTSG
LNTSVVFGFL		NLVLWVGNLW		FVFKETGWAA		PFLRAPPGAP		EKQPAPGDAY
GDAGYGQGPG		GYGPQDSYGP		QGGYQPDYGQ		PAGSGGSGYG		PQGDYGQQGY
GPQGAPTSFS		NQM

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іоном кальцію. Локалізований у мембрані, клітинних контактах, цитоплазматичних везикулах, синапсах, синаптосомах.

Література

• Suedhof T.C., Lottspeich F., Greengard P., Mehl E., Jahn R. (1987). The cDNA and derived amino acid sequences for rat and human synaptophysin. Nucleic Acids Res. 15: 9607—9607. PMID 3120152 DOI:10.1093/nar/15.22.9607
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома X