ACSS1

ACSS1
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 3GLR, 3GLT, 3GLU, 4BVE, 4BVF, 4BVG, 4C78
Ідентифікатори
Символи	ACSS1, ACAS2L, ACECS1, AceCS2L, acyl-CoA synthetase short-chain family member 1, acyl-CoA synthetase short chain family member 1
Зовнішні ІД	OMIM: 614355 MGI: 1915988 HomoloGene: 56037 GeneCards: ACSS1
Онтологія гена Молекулярна функція • nucleotide binding • ligase activity • AMP binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • ATP binding • каталітична активність • acetate-CoA ligase activity Клітинна компонента • мітохондріальний матрикс • мітохондрія Біологічний процес • обмін речовин • acetyl-CoA biosynthetic process • acetyl-CoA biosynthetic process from acetate • acetate biosynthetic process • propionate biosynthetic process • ethanol oxidation Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	84532	68738
Ensembl	ENSG00000154930	ENSMUSG00000027452
UniProt	Q9NUB1	Q99NB1
RefSeq (мРНК)	NM_001252675 NM_001252676 NM_001252677 NM_032501	NM_080575
RefSeq (білок)	NP_001239604 NP_001239605 NP_001239606 NP_115890	NP_542142
Локус (UCSC)	Хр. 20: 25.01 – 25.06 Mb	Хр. 2: 150.46 – 150.51 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

ACSS1 (англ. Acyl-CoA synthetase short chain family member 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 20-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 689 амінокислот, а молекулярна маса — 74 857.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MAARTLGRGV		GRLLGSLRGL		SGQPARPPCG		VSAPRRAASG		PSGSAPAVAA
AAAQPGSYPA		LSAQAAREPA		AFWGPLARDT		LVWDTPYHTV		WDCDFSTGKI
GWFLGGQLNV		SVNCLDQHVR		KSPESVALIW		ERDEPGTEVR		ITYRELLETT
CRLANTLKRH		GVHRGDRVAI		YMPVSPLAVA		AMLACARIGA		VHTVIFAGFS
AESLAGRIND		AKCKVVITFN		QGLRGGRVVE		LKKIVDEAVK		HCPTVQHVLV
AHRTDNKVHM		GDLDVPLEQE		MAKEDPVCAP		ESMGSEDMLF		MLYTSGSTGM
PKGIVHTQAG		YLLYAALTHK		LVFDHQPGDI		FGCVADIGWI		TGHSYVVYGP
LCNGATSVLF		ESTPVYPNAG		RYWETVERLK		INQFYGAPTA		VRLLLKYGDA
WVKKYDRSSL		RTLGSVGEPI		NCEAWEWLHR		VVGDSRCTLV		DTWWQTETGG
ICIAPRPSEE		GAEILPAMAM		RPFFGIVPVL		MDEKGSVVEG		SNVSGALCIS
QAWPGMARTI		YGDHQRFVDA		YFKAYPGYYF		TGDGAYRTEG		GYYQITGRMD
DVINISGHRL		GTAEIEDAIA		DHPAVPESAV		IGYPHDIKGE		AAFAFIVVKD
SAGDSDVVVQ		ELKSMVATKI		AKYAVPDEIL		VVKRLPKTRS		GKVMRRLLRK
IITSEAQELG		DTTTLEDPSI		IAEILSVYQK		CKDKQAAAK

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до лігаз. Задіяний у таких біологічних процесах, як ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами. Локалізований у мітохондрії.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Nagase T., Nakayama M., Nakajima D., Kikuno R., Ohara O. (2001). Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. XX. The complete sequences of 100 new cDNA clones from brain which code for large proteins in vitro. DNA Res. 8: 85—95. PMID 11347906 DOI:10.1093/dnares/8.2.85
• Schwer B., Bunkenborg J., Verdin R.O., Andersen J.S., Verdin E. (2006). Reversible lysine acetylation controls the activity of the mitochondrial enzyme acetyl-CoA synthetase 2. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 103: 10224—10229. PMID 16788062 DOI:10.1073/pnas.0603968103

Див. також

• Хромосома 20