AGBL4

AGBL4
Ідентифікатори
Символи	AGBL4, CCP6, ATP/GTP binding protein-like 4, ATP/GTP binding protein like 4, AGBL carboxypeptidase 4
Зовнішні ІД	OMIM: 616476 MGI: 1918244 HomoloGene: 84880 GeneCards: AGBL4
Онтологія гена Молекулярна функція • carboxypeptidase activity • tubulin binding • zinc ion binding • GO:0070122 peptidase activity • hydrolase activity • metallopeptidase activity • зв'язування з іоном металу • metallocarboxypeptidase activity Клітинна компонента • цитоплазма • ciliary basal body • Центріоль • гіалоплазма • комплекс Ґольджі • cell projection • цитоскелет Біологічний процес • C-terminal protein deglutamylation • protein side chain deglutamylation • протеоліз • protein deglutamylation • defense response to virus Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	84871	78933
Ensembl	ENSG00000186094	ENSMUSG00000061298
UniProt	Q5VU57	Q09LZ8
RefSeq (мРНК)	NM_032785 NM_001323573 NM_001323574 NM_001323575	NM_001048189 NM_001284190 NM_030231
RefSeq (білок)	NP_001310502 NP_001310503 NP_001310504 NP_116174	NP_001041654 NP_001271119 NP_084507
Локус (UCSC)	Хр. 1: 48.53 – 50.02 Mb	Хр. 4: 110.25 – 111.52 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

AGBL4 (англ. ATP/GTP binding protein like 4) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 1-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 503 амінокислот, а молекулярна маса — 58 230.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MAEGSQSAPE		AGNDMGNDDA		IGGNVSKYIV		LPTGYCGQPK		KGHLIFDACF
ESGNLGRVDQ		VSEFEYDLFI		RPDTCNPRFR		VWFNFTVENV		KESQRVIFNI
VNFSKTKSLY		RDGMAPMVKS		TSRPKWQRLP		PKNVYYYRCP		DHRKNYVMSF
AFCFDREEDI		YQFAYCYPYT		YTRFQHYLDS		LQKRNMDYFF		REQLGQSVQQ
RKLDLLTITS		PDNLREGAEQ		KVVFITGRVH		PGETPSSFVC		QGIIDFLVSQ
HPIACVLREY		LVFKIAPMLN		PDGVYLGNYR		CSLMGFDLNR		HWLDPSPWVH
PTLHGVKQLI		VQMYNDPKTS		LEFYIDIHAH		STMMNGFMYG		NIFEDEERFQ
RQAIFPKLLC		QNAEDFSYSS		TSFNRDAVKA		GTGRRFLGGL		LDHTSYCYTL
EVSFYSYIIS		GTTAAVPYTE		EAYMKLGRNV		ARTFLDYYRL		NPVVEKVAIP
MPRLRNKEIE		VQRRKEKSPP		YKHPLLRGPA		SNYPNSKGDK		KSSVNHKDPS
TPF

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, протеаз, металопротеаз, карбоксипептидаз. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у цитоплазмі, цитоскелеті, клітинних відростках, апараті гольджі.

Література

• Rodriguez de la Vega Otazo M., Lorenzo J., Tort O., Aviles F.X., Bautista J.M. (2013). Functional segregation and emerging role of cilia-related cytosolic carboxypeptidases (CCPs). FASEB J. 27: 424—431. PMID 23085998 doi:10.1096/fj.12-209080

Див. також

• Хромосома 1