AGO4

AGO4
Ідентифікатори
Символи	AGO4, EIF2C4, argonaute 4, RISC catalytic component, argonaute RISC catalytic component 4, argonaute RISC component 4
Зовнішні ІД	OMIM: 607356 MGI: 1924100 HomoloGene: 41184 GeneCards: AGO4
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • single-stranded RNA binding • RNA binding • nucleic acid binding • double-stranded RNA binding • miRNA binding Клітинна компонента • мембрана • P-body • RISC-loading complex • цитоплазма • клітинне ядро • нуклеоплазма • гіалоплазма • RISC • ядерні тільця Біологічний процес • mRNA destabilization-mediated gene silencing by siRNA • mRNA catabolic process • pre-miRNA processing • GO:0035194 РНК-інтерференція • RNA secondary structure unwinding • mRNA destabilization-mediated gene silencing by miRNA • regulation of translation • production of miRNAs involved in gene silencing by miRNA • Wnt signaling pathway, calcium modulating pathway • Сайленсинг генів • regulation of cell morphogenesis • synaptonemal complex assembly • GO:0061715 miRNA metabolic process • negative regulation of apoptotic process • male meiotic nuclear division • male gonad development • miRNA-mediated gene silencing by inhibition of translation • regulation of megakaryocyte differentiation • GO:1901313 positive regulation of gene expression • negative regulation of gene expression Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	192670	76850
Ensembl	ENSG00000134698	ENSMUSG00000042500
UniProt	Q9HCK5	Q8CJF8
RefSeq (мРНК)	NM_017629	NM_153177
RefSeq (білок)	NP_060099	NP_694817
Локус (UCSC)	Хр. 1: 35.81 – 35.86 Mb	Хр. 4: 126.38 – 126.43 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

AGO4 (англ. Argonaute 4, RISC catalytic component) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 1-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 861 амінокислот, а молекулярна маса — 97 097.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MEALGPGPPA		SLFQPPRRPG		LGTVGKPIRL		LANHFQVQIP		KIDVYHYDVD
IKPEKRPRRV		NREVVDTMVR		HFKMQIFGDR		QPGYDGKRNM		YTAHPLPIGR
DRVDMEVTLP		GEGKDQTFKV		SVQWVSVVSL		QLLLEALAGH		LNEVPDDSVQ
ALDVITRHLP		SMRYTPVGRS		FFSPPEGYYH		PLGGGREVWF		GFHQSVRPAM
WNMMLNIDVS		ATAFYRAQPI		IEFMCEVLDI		QNINEQTKPL		TDSQRVKFTK
EIRGLKVEVT		HCGQMKRKYR		VCNVTRRPAS		HQTFPLQLEN		GQAMECTVAQ
YFKQKYSLQL		KYPHLPCLQV		GQEQKHTYLP		LEVCNIVAGQ		RCIKKLTDNQ
TSTMIKATAR		SAPDRQEEIS		RLVKSNSMVG		GPDPYLKEFG		IVVHNEMTEL
TGRVLPAPML		QYGGRNKTVA		TPNQGVWDMR		GKQFYAGIEI		KVWAVACFAP
QKQCREDLLK		SFTDQLRKIS		KDAGMPIQGQ		PCFCKYAQGA		DSVEPMFKHL
KMTYVGLQLI		VVILPGKTPV		YAEVKRVGDT		LLGMATQCVQ		VKNVVKTSPQ
TLSNLCLKIN		AKLGGINNVL		VPHQRPSVFQ		QPVIFLGADV		THPPAGDGKK
PSIAAVVGSM		DGHPSRYCAT		VRVQTSRQEI		SQELLYSQEV		IQDLTNMVRE
LLIQFYKSTR		FKPTRIIYYR		GGVSEGQMKQ		VAWPELIAIR		KACISLEEDY
RPGITYIVVQ		KRHHTRLFCA		DKTERVGKSG		NVPAGTTVDS		TITHPSEFDF
YLCSHAGIQG		TSRPSHYQVL		WDDNCFTADE		LQLLTYQLCH		TYVRCTRSVS
IPAPAYYARL		VAFRARYHLV		DKDHDSAEGS		HVSGQSNGRD		PQALAKAVQI
HHDTQHTMYF		A

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до рибонуклеопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як регуляція трансляції, РНК-залежне заглушення генів. Білок має сайт для зв'язування з РНК. Локалізований у цитоплазмі.

Література

• Nagase T., Kikuno R., Nakayama M., Hirosawa M., Ohara O. (2000). Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. XVIII. The complete sequences of 100 new cDNA clones from brain which code for large proteins in vitro. DNA Res. 7: 273—281. PMID 10997877 doi:10.1093/dnares/7.4.271
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
• Pillai R.S., Artus C.G., Filipowicz W. (2004). Tethering of human Ago proteins to mRNA mimics the miRNA-mediated repression of protein synthesis. RNA. 10: 1518—1525. PMID 15337849 doi:10.1261/rna.7131604
• Wu L., Fan J., Belasco J.G. (2008). Importance of translation and nonnucleolytic ago proteins for on-target RNA interference. Curr. Biol. 18: 1327—1332. PMID 18771919 doi:10.1016/j.cub.2008.07.072

Див. також

• Хромосома 1