AIM2

AIM2
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 3RN2, 3RN5, 3VD8, 4O7Q
Ідентифікатори
Символи	AIM2, PYHIN4, absent in melanoma 2
Зовнішні ІД	OMIM: 604578 MGI: 2686159 HomoloGene: 83226 GeneCards: AIM2
Онтологія гена Молекулярна функція • DNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • identical protein binding • double-stranded DNA binding Клітинна компонента • цитоплазма • AIM2 inflammasome complex • клітинне ядро • нуклеоплазма • мітохондрія • гіалоплазма Біологічний процес • positive regulation of cysteine-type endopeptidase activity • Піроптоз • cellular response to interferon-beta • процес імунної системи • tumor necrosis factor-mediated signaling pathway • positive regulation of NF-kappaB transcription factor activity • GO:0046730, GO:0046737, GO:0046738, GO:0046736 імунна відповідь • positive regulation of interleukin-1 beta production • positive regulation of protein oligomerization • activation of innate immune response • inflammatory response • negative regulation of NF-kappaB transcription factor activity • positive regulation of defense response to virus by host • GO:0097285 апоптоз • вроджений імунітет Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	9447	383619
Ensembl	ENSG00000163568	ENSMUSG00000037860
UniProt	O14862	Q91VJ1
RefSeq (мРНК)	NM_004833 NM_001348247	NM_001013779
RefSeq (білок)	NP_004824 NP_001335176	NP_001013801
Локус (UCSC)	Хр. 1: 159.06 – 159.19 Mb	Хр. 1: 173.35 – 173.47 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

AIM2 (англ. Absent in melanoma 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 343 амінокислот, а молекулярна маса — 38 954.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MESKYKEILL		LTGLDNITDE		ELDRFKFFLS		DEFNIATGKL		HTANRIQVAT
LMIQNAGAVS		AVMKTIRIFQ		KLNYMLLAKR		LQEEKEKVDK		QYKSVTKPKP
LSQAEMSPAA		SAAIRNDVAK		QRAAPKVSPH		VKPEQKQMVA		QQESIREGFQ
KRCLPVMVLK		AKKPFTFETQ		EGKQEMFHAT		VATEKEFFFV		KVFNTLLKDK
FIPKRIIIIA		RYYRHSGFLE		VNSASRVLDA		ESDQKVNVPL		NIIRKAGETP
KINTLQTQPL		GTIVNGLFVV		QKVTEKKKNI		LFDLSDNTGK		MEVLGVRNED
TMKCKEGDKV		RLTFFTLSKN		GEKLQLTSGV		HSTIKVIKAK		KKT

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах як апоптоз, імунітет, вроджений імунітет, запальна відповідь, поліморфізм. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
• Fernandes-Alnemri T., Yu J.W., Datta P., Wu J., Alnemri E.S. (2009). AIM2 activates the inflammasome and cell death in response to cytoplasmic DNA. Nature. 458: 509—513. PMID 19158676 doi:10.1038/nature07710
• Veeranki S., Duan X., Panchanathan R., Liu H., Choubey D. (2011). IFI16 protein mediates the anti-inflammatory actions of the type-I interferons through suppression of activation of caspase-1 by inflammasomes. PLoS ONE. 6: E27040—E27040. PMID 22046441 doi:10.1371/journal.pone.0027040

Див. також

• Хромосома 1