AMFR

AMFR
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	2EJS, 2LVN, 2LVO, 2LVP, 2LVQ, 2LXH, 2LXP, 3FSH, 3H8K, 3TIW, 4G3O, 4LAD
Ідентифікатори
Символи	AMFR, GP78, RNF45, autocrine motility factor receptor
Зовнішні ІД	OMIM: 603243 MGI: 1345634 HomoloGene: 888 GeneCards: AMFR
Онтологія гена
Молекулярна функція	• protein-macromolecule adaptor activity; • chaperone binding; • GO:1904264, GO:1904822, GO:0090622, GO:0090302 ubiquitin protein ligase activity; • зв'язування з іоном металу; • GO:0050372 ubiquitin-protein transferase activity; • ubiquitin-ubiquitin ligase activity; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • ubiquitin-specific protease binding; • transferase activity; • identical protein binding; • BAT3 complex binding; • signaling receptor activity;
Клітинна компонента	• цитоплазма; • integral component of membrane; • мембрана; • growth cone; • integral component of endoplasmic reticulum membrane; • soma; • дендрит (нейробіологія); • Derlin-1 retrotranslocation complex; • perinuclear region of cytoplasm; • клітинне ядро; • ендоплазматичний ретикулум; • endoplasmic reticulum membrane; • комплекс Ґольджі; • endoplasmic reticulum quality control compartment; • GO:0009327 protein-containing complex; • ubiquitin ligase complex; • гіалоплазма;
Біологічний процес	• ERAD pathway; • ubiquitin-dependent protein catabolic process; • GO:0010260 старіння людини; • protein polyubiquitination; • Відповідь на незгорнуті білки; • protein K48-linked ubiquitination; • protein complex oligomerization; • Убіквітин-залежний протеоліз; • ubiquitin-dependent ERAD pathway; • learning or memory; • positive regulation of protein binding; • GO:0072468 сигнальна трансдукція; • protein autoubiquitination; • згортання білків; • endoplasmic reticulum mannose trimming;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ;
	Більше даних
Ортологи
	267
	23802
	ENSG00000159461
	ENSMUSG00000031751
	Q9UKV5
	Q9R049
	NM_001144; NM_138958; NM_001323511; NM_001323512
	NM_011787
	NP_001135; NP_001310440; NP_001310441
	NP_035917
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

AMFR (англ. Autocrine motility factor receptor) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 16-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 643 амінокислот, а молекулярна маса — 72 996^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MPLLFLERFP	WPSLRTYTGL	SGLALLGTII	SAYRALSQPE	AGPGEPDQLT
ASLQPEPPAP	ARPSAGGPRA	RDVAQYLLSD	SLFVWVLVNT	ACCVLMLVAK
LIQCIVFGPL	RVSERQHLKD	KFWNFIFYKF	IFIFGVLNVQ	TVEEVVMWCL
WFAGLVFLHL	MVQLCKDRFE	YLSFSPTTPM	SSHGRVLSLL	VAMLLSCCGL
AAVCSITGYT	HGMHTLAFMA	AESLLVTVRT	AHVILRYVIH	LWDLNHEGTW
EGKGTYVYYT	DFVMELTLLS	LDLMHHIHML	LFGNIWLSMA	SLVIFMQLRY
LFHEVQRRIR	RHKNYLRVVG	NMEARFAVAT	PEELAVNNDD	CAICWDSMQA
ARKLPCGHLF	HNSCLRSWLE	QDTSCPTCRM	SLNIADNNRV	REEHQGENLD
ENLVPVAAAE	GRPRLNQHNH	FFHFDGSRIA	SWLPSFSVEV	MHTTNILGIT
QASNSQLNAM	AHQIQEMFPQ	VPYHLVLQDL	QLTRSVEITT	DNILEGRIQV
PFPTQRSDSI	RPALNSPVER	PSSDQEEGET	SAQTERVPLD	LSPRLEETLD
FGEVEVEPSE	VEDFEARGSR	FSKSADERQR	MLVQRKDELL	QQARKRFLNK
SSEDDAASES	FLPSEGASSD	PVTLRRRMLA	AAAERRLQKQ	QTS

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, рецепторів, фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як убіквітинування білків. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у мембрані, ендоплазматичному ретикулумі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Huang B., Xie Y., Raz A. (1995). Identification of an upstream region that controls the transcription of the human autocrine motility factor receptor. Biochem. Biophys. Res. Commun. 212: 727—742. PMID 7626106 DOI:10.1006/bbrc.1995.2031
Song B.L., Sever N., DeBose-Boyd R.A. (2005). Gp78, a membrane-anchored ubiquitin ligase, associates with Insig-1 and couples sterol-regulated ubiquitination to degradation of HMG CoA reductase. Mol. Cell. 19: 829—840. PMID 16168377 DOI:10.1016/j.molcel.2005.08.009
Hanzelmann P., Schindelin H. (2011). The structural and functional basis of the p97/valosin-containing protein (VCP)-interacting motif (VIM): mutually exclusive binding of cofactors to the N-terminal domain of p97. J. Biol. Chem. 286: 38679—38690. PMID 21914798 DOI:10.1074/jbc.M111.274506

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:463 (англ.) . Архів оригіналу за 15 вересня 2015. Процитовано 11 вересня 2017. [Архівовано 2015-09-15 у Wayback Machine.]
↑ UniProt, Q9UKV5 (англ.) . Архів оригіналу за 8 серпня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 16

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

Портал «Біологія» Портал «Хімія»

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:463 (англ.) . Архів оригіналу за 15 вересня 2015. Процитовано 11 вересня 2017. [Архівовано 2015-09-15 у Wayback Machine.]

[UniProt-4] UniProt, Q9UKV5 (англ.) . Архів оригіналу за 8 серпня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]