ANKHD1

ANKHD1
Ідентифікатори
Символи	ANKHD1, MASK, VBARP, MASK1, PP2500, ankyrin repeat and KH domain containing 1
Зовнішні ІД	OMIM: 610500 HomoloGene: 87006 GeneCards: ANKHD1
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • nucleic acid binding • RNA binding Клітинна компонента • цитоплазма Біологічний процес • вроджений імунітет Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	54882	100529260
Ensembl	ENSG00000131503	н/д
UniProt	Q8IWZ3	н/д
RefSeq (мРНК)	NM_024668 NM_001197030 NM_017747 NM_017978	NM_001204053
RefSeq (білок)	NP_065741 NP_001183959 NP_060217 NP_060448 NP_078944	н/д
Локус (UCSC)	Хр. 5: 140.4 – 140.54 Mb	н/д
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

ANKHD1 (англ. ANKHD1-EIF4EBP3 readthrough) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 2 542 амінокислот, а молекулярна маса — 269 458.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MLTDSGGGGT		SFEEDLDSVA		PRSAPAGASE		PPPPGGVGLG		IRTVRLFGEA
GPASGVGSSG		GGGSGSGTGG		GDAALDFKLA		AAVLRTGGGG		GASGSDEDEV
SEVESFILDQ		EDLDNPVLKT		TSEIFLSSTA		EGADLRTVDP		ETQARLEALL
EAAGIGKLST		ADGKAFADPE		VLRRLTSSVS		CALDEAAAAL		TRMKAENSHN
AGQVDTRSLA		EACSDGDVNA		VRKLLDEGRS		VNEHTEEGES		LLCLACSAGY
YELAQVLLAM		HANVEDRGNK		GDITPLMAAS		SGGYLDIVKL		LLLHDADVNS
QSATGNTALT		YACAGGFVDI		VKVLLNEGAN		IEDHNENGHT		PLMEAASAGH
VEVARVLLDH		GAGINTHSNE		FKESALTLAC		YKGHLDMVRF		LLEAGADQEH
KTDEMHTALM		EACMDGHVEV		ARLLLDSGAQ		VNMPADSFES		PLTLAACGGH
VELAALLIER		GANLEEVNDE		GYTPLMEAAR		EGHEEMVALL		LAQGANINAQ
TEETQETALT		LACCGGFSEV		ADFLIKAGAD		IELGCSTPLM		EASQEGHLEL
VKYLLASGAN		VHATTATGDT		ALTYACENGH		TDVADVLLQA		GADLEHESEG
GRTPLMKAAR		AGHLCTVQFL		ISKGANVNRA		TANNDHTVVS		LACAGGHLAV
VELLLAHGAD		PTHRLKDGST		MLIEAAKGGH		TNVVSYLLDY		PNNVLSVPTT
DVSQLPPPSQ		DQSQVPRVPT		HTLAMVVPPQ		EPDRTSQENS		PALLGVQKGT
SKQKSSSLQV		ADQDLLPSFH		PYQPLECIVE		ETEGKLNELG		QRISAIEKAQ
LKSLELIQGE		PLNKDKIEEL		KKNREEQVQK		KKKILKELQK		VERQLQMKTQ
QQFTKEYLET		KGQKDTVSLH		QQCSHRGVFP		EGEGDGSLPE		DHFSELPQVD
TILFKDNDVD		DEQQSPPSAE		QIDFVPVQPL		SSPQCNFSSD		LGSNGTNSLE
LQKVSGNQQI		VGQPQIAITG		HDQGLLVQEP		DGLMVATPAQ		TLTDTLDDLI
AAVSTRVPTG		SNSSSQTTEC		LTPESCSQTT		SNVASQSMPP		VYPSVDIDAH
TESNHDTALT		LACAGGHEEL		VSVLIARDAK		IEHRDKKGFT		PLILAATAGH
VGVVEILLDK		GGDIEAQSER		TKDTPLSLAC		SGGRQEVVDL		LLARGANKEH
RNVSDYTPLS		LAASGGYVNI		IKILLNAGAE		INSRTGSKLG		ISPLMLAAMN
GHVPAVKLLL		DMGSDINAQI		ETNRNTALTL		ACFQGRAEVV		SLLLDRKANV
EHRAKTGLTP		LMEAASGGYA		EVGRVLLDKG		ADVNAPPVPS		SRDTALTIAA
DKGHYKFCEL		LIHRGAHIDV		RNKKGNTPLW		LASNGGHFDV		VQLLVQAGAD
VDAADNRKIT		PLMSAFRKGH		VKVVQYLVKE		VNQFPSDIEC		MRYIATITDK
ELLKKCHQCV		ETIVKAKDQQ		AAEANKNASI		LLKELDLEKS		REESRKQALA
AKREKRKEKR		KKKKEEQKRK		QEEDEENKPK		ENSELPEDED		EEENDEDVEQ
EVPIEPPSAT		TTTTIGISAT		SATFTNVFGK		KRANVVTTPS		TNRKNKKNKT
KETPPTAHLI		LPEQHMSLAQ		QKADKNKING		EPRGGGAGGN		SDSDNLDSTD
CNSESSSGGK		SQELNFVMDV		NSSKYPSLLL		HSQEEKTSTA		TSKTQTRLEG
EVTPNSLSTS		YKTVSLPLSS		PNIKLNLTSP		KRGQKREEGW		KEVVRRSKKL
SVPASVVSRI		MGRGGCNITA		IQDVTGAHID		VDKQKDKNGE		RMITIRGGTE
STRYAVQLIN		ALIQDPAKEL		EDLIPKNHIR		TPASTKSIHA		NFSSGVGTTA
ASSKNAFPLG		APTLVTSQAT		TLSTFQPANK		LNKNVPTNVR		SSFPVSLPLA
YPHPHFALLA		AQTMQQIRHP		RLPMAQFGGT		FSPSPNTWGP		FPVRPVNPGN
TNSSPKHNNT		SRLPNQNGTV		LPSESAGLAT		ASCPITVSSV		VAASQQLCVT
NTRTPSSVRK		QLFACVPKTS		PPATVISSVT		STCSSLPSVS		SAPITSGQAP
TTFLPASTSQ		AQLSSQKMES		FSAVPPTKEK		VSTQDQPMAN		LCTPSSTANS
CSSSASNTPG		APETHPSSSP		TPTSSNTQEE		AQPSSVSDLS		PMSMPFASNS
EPAPLTLTSP		RMVAADNQDT		SNLPQLAVPA		PRVSHRMQPR		GSFYSMVPNA
TIHQDPQSIF		VTNPVTLTPP		QGPPAAVQLS		SAVNIMNGSQ		MHINPANKSL
PPTFGPATLF		NHFSSLFDSS		QVPANQGWGD		GPLSSRVATD		ASFTVQSAFL
GNSVLGHLEN		MHPDNSKAPG		FRPPSQRVST		SPVGLPSIDP		SGSSPSSSSA
PLASFSGIPG		TRVFLQGPAP		VGTPSFNRQH		FSPHPWTSAS		NSSTSAPPTL
GQPKGVSASQ		DRKIPPPIGT		ERLARIRQGG		SVAQAPAGTS		FVAPVGHSGI
WSFGVNAVSE		GLSGWSQSVM		GNHPMHQQLS		DPSTFSQHQP		MERDDSGMVA
PSNIFHQPMA		SGFVDFSKGL		PISMYGGTII		PSHPQLADVP		GGPLFNGLHN
PDPAWNPMIK		VIQNSTECTD		AQQIWPGTWA		PHIGNMHLKY		VN

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як ацетилювання, альтернативний сплайсинг, поліморфізм. Білок має сайт для зв'язування з РНК. Локалізований у цитоплазмі.

Література

• Poulin F., Brueschke A., Sonenberg N. (2003). Gene fusion and overlapping reading frames in the mammalian genes for 4E-BP3 and MASK. J. Biol. Chem. 278: 52290—52297. PMID 14557257 DOI:10.1074/jbc.M310761200
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Beausoleil S.A., Villen J., Gerber S.A., Rush J., Gygi S.P. (2006). A probability-based approach for high-throughput protein phosphorylation analysis and site localization. Nat. Biotechnol. 24: 1285—1292. PMID 16964243 DOI:10.1038/nbt1240

Див. також

• Хромосома 5