ANTXR1

ANTXR1
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 3N2N
Ідентифікатори
Символи	ANTXR1, ATR, GAPO, TEM8, anthrax toxin receptor 1, ANTXR cell adhesion molecule 1
Зовнішні ІД	OMIM: 606410 MGI: 1916788 HomoloGene: 12976 GeneCards: ANTXR1
Пов'язані генетичні захворювання
GAPO syndrome
Онтологія гена Молекулярна функція • actin filament binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • collagen binding • transmembrane signaling receptor activity • зв'язування з іоном металу • signaling receptor activity Клітинна компонента • integral component of membrane • cell surface • клітинна мембрана • cell projection • endosome membrane • lamellipodium membrane • екзосома • мембрана • filopodium membrane • external side of plasma membrane Біологічний процес • actin cytoskeleton reorganization • розмножувальний процес • substrate adhesion-dependent cell spreading • GO:0072468 сигнальна трансдукція • positive regulation of metallopeptidase activity • negative regulation of extracellular matrix assembly • blood vessel development • toxin transport Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	84168	69538
Ensembl	ENSG00000169604	ENSMUSG00000033420
UniProt	Q9H6X2 Q96EC6	Q9CZ52
RefSeq (мРНК)	NM_018153 NM_032208 NM_053034	NM_054041
RefSeq (білок)	NP_060623 NP_115584 NP_444262 NP_060623.2	NP_473382
Локус (UCSC)	Хр. 2: 69.01 – 69.25 Mb	Хр. 6: 87.11 – 87.31 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

ANTXR1 (англ. Anthrax toxin receptor 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 564 амінокислот, а молекулярна маса — 62 789.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MATAERRALG		IGFQWLSLAT		LVLICAGQGG		RREDGGPACY		GGFDLYFILD
KSGSVLHHWN		EIYYFVEQLA		HKFISPQLRM		SFIVFSTRGT		TLMKLTEDRE
QIRQGLEELQ		KVLPGGDTYM		HEGFERASEQ		IYYENRQGYR		TASVIIALTD
GELHEDLFFY		SEREANRSRD		LGAIVYCVGV		KDFNETQLAR		IADSKDHVFP
VNDGFQALQG		IIHSILKKSC		IEILAAEPST		ICAGESFQVV		VRGNGFRHAR
NVDRVLCSFK		INDSVTLNEK		PFSVEDTYLL		CPAPILKEVG		MKAALQVSMN
DGLSFISSSV		IITTTHCSDG		SILAIALLIL		FLLLALALLW		WFWPLCCTVI
IKEVPPPPAE		ESEEEDDDGL		PKKKWPTVDA		SYYGGRGVGG		IKRMEVRWGE
KGSTEEGAKL		EKAKNARVKM		PEQEYEFPEP		RNLNNNMRRP		SSPRKWYSPI
KGKLDALWVL		LRKGYDRVSV		MRPQPGDTGR		CINFTRVKNN		QPAKYPLNNA
YHTSSPPPAP		IYTPPPPAPH		CPPPPPSAPT		PPIPSPPSTL		PPPPQAPPPN
RAPPPSRPPP		RPSV

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до рецепторів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані, клітинних відростках.

Література

• Bradley K.A., Mogridge J., Mourez M., Collier R.J., Young J.A.T. (2001). Identification of the cellular receptor for anthrax toxin. Nature. 414: 225—229. PMID 11700562 DOI:10.1038/n35101999
• Vargas M., Karamsetty R., Leppla S.H., Chaudry G.J. (2012). Broad expression analysis of human ANTXR1/TEM8 transcripts reveals differential expression and novel splizce variants. PLoS ONE. 7: E43174—E43174. PMID 22912819 DOI:10.1371/journal.pone.0043174
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Scobie H.M., Rainey G.J.A., Bradley K.A., Young J.A.T. (2003). Human capillary morphogenesis protein 2 functions as an anthrax toxin receptor. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 100: 5170—5174. PMID 12700348 DOI:10.1073/pnas.0431098100
• Hillman R.T., Green R.E., Brenner S.E. (2004). An unappreciated role for RNA surveillance. Genome Biol. 5: R8.1—R8.16. PMID 14759258 DOI:10.1186/gb-2004-5-2-r8
• Werner E., Kowalczyk A.P., Faundez V. (2006). Anthrax toxin receptor 1/tumor endothelium marker 8 mediates cell spreading by coupling extracellular ligands to the actin cytoskeleton. J. Biol. Chem. 281: 23227—23236. PMID 16762926 DOI:10.1074/jbc.M603676200

Див. також

• Хромосома 2