APOBEC3F

APOBEC3F
Наявні структури
PDB	Пошук для людей: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	3WUS, 4IOU, 4J4J, 5HX5, 5HX4
Ідентифікатори
Символи	APOBEC3F, A3F, ARP8, BK150C2.4.MRNA, KA6, apolipoprotein B mRNA editing enzyme catalytic subunit 3F
Зовнішні ІД	OMIM: 608993 HomoloGene: 105867 GeneCards: APOBEC3F
Онтологія гена
Молекулярна функція	• cytidine deaminase activity; • zinc ion binding; • зв'язування з іоном металу; • hydrolase activity, acting on carbon-nitrogen (but not peptide) bonds, in cyclic amidines; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • каталітична активність; • RNA binding; • hydrolase activity; • identical protein binding;
Клітинна компонента	• цитоплазма; • P-body; • apolipoprotein B mRNA editing enzyme complex; • клітинне ядро; • Рибонуклеопротеїни;
Біологічний процес	• negative regulation of transposition; • negative regulation of viral process; • процес імунної системи; • base conversion or substitution editing; • negative regulation of viral genome replication; • defense response to virus; • DNA cytosine deamination; • DNA demethylation; • вроджений імунітет; • negative regulation of single stranded viral RNA replication via double stranded DNA intermediate; • positive regulation of defense response to virus by host; • cytidine deamination; • cytidine to uridine editing;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
	200316
	н/д
	ENSG00000128394
	н/д
	Q8IUX4
	н/д
	NM_001006666; NM_145298
	н/д
	NP_001006667; NP_660341
	н/д
	Вікідані
Див./Ред. для людей

APOBEC3F (англ. Apolipoprotein B mRNA editing enzyme catalytic subunit 3F) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 22-ї хромосоми. ^[2] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 373 амінокислот, а молекулярна маса — 45 020^[3].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MKPHFRNTVE	RMYRDTFSYN	FYNRPILSRR	NTVWLCYEVK	TKGPSRPRLD
AKIFRGQVYS	QPEHHAEMCF	LSWFCGNQLP	AYKCFQITWF	VSWTPCPDCV
AKLAEFLAEH	PNVTLTISAA	RLYYYWERDY	RRALCRLSQA	GARVKIMDDE
EFAYCWENFV	YSEGQPFMPW	YKFDDNYAFL	HRTLKEILRN	PMEAMYPHIF
YFHFKNLRKA	YGRNESWLCF	TMEVVKHHSP	VSWKRGVFRN	QVDPETHCHA
ERCFLSWFCD	DILSPNTNYE	VTWYTSWSPC	PECAGEVAEF	LARHSNVNLT
IFTARLYYFW	DTDYQEGLRS	LSQEGASVEI	MGYKDFKYCW	ENFVYNDDEP
FKPWKGLKYN	FLFLDSKLQE	ILE

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до гідролаз. Задіяний у таких біологічних процесах як імунітет, вроджений імунітет, антивірусний захист. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у цитоплазмі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Wedekind J.E., Dance G.S.C., Sowden M.P., Smith H.C. (2003). Messenger RNA editing in mammals: new members of the APOBEC family seeking roles in the family business. Trends Genet. 19: 207—216. PMID 12683974 DOI:10.1016/S0168-9525(03)00054-4
Wiegand H.L., Doehle B.P., Bogerd H.P., Cullen B.R. (2004). A second human antiretroviral factor, APOBEC3F, is suppressed by the HIV-1 and HIV-2 Vif proteins. EMBO J. 23: 2451—2458. PMID 15152192 DOI:10.1038/sj.emboj.7600246
Hakata Y., Landau N.R. (2006). Reversed functional organization of mouse and human APOBEC3 cytidine deaminase domains. J. Biol. Chem. 281: 36624—36631. PMID 17020885 DOI:10.1074/jbc.M604980200
Wichroski M.J., Robb G.B., Rana T.M. (2006). Human retroviral host restriction factors APOBEC3G and APOBEC3F localize to mRNA processing bodies. PLoS Pathog. 2: E41—E41. PMID 16699599 DOI:10.1371/journal.ppat.0020041
Chiu Y.L., Greene W.C. (2008). The APOBEC3 cytidine deaminases: an innate defensive network opposing exogenous retroviruses and endogenous retroelements. Annu. Rev. Immunol. 26: 317—353. PMID 18304004 DOI:10.1146/annurev.immunol.26.021607.090350

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:17356 (англ.) . Процитовано 22 серпня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, Q8IUX4 (англ.) . Архів оригіналу за 2 березня 2018. Процитовано 22 серпня 2017.

Див. також

Хромосома 22

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

Портал «Біологія» Портал «Хімія»

[1] Human PubMed Reference:.

[HGNC-2] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:17356 (англ.) . Процитовано 22 серпня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)

[UniProt-3] UniProt, Q8IUX4 (англ.) . Архів оригіналу за 2 березня 2018. Процитовано 22 серпня 2017.

[1]

[2]

[3]