APOBEC3H

APOBEC3H
Ідентифікатори
Символи	APOBEC3H, A3H, ARP-10, ARP10, apolipoprotein B mRNA editing enzyme catalytic subunit 3H
Зовнішні ІД	OMIM: 610976 HomoloGene: 52306 GeneCards: APOBEC3H
Онтологія гена Молекулярна функція • hydrolase activity, acting on carbon-nitrogen (but not peptide) bonds, in cyclic amidines • cytidine deaminase activity • zinc ion binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • каталітична активність • hydrolase activity • зв'язування з іоном металу • RNA binding Клітинна компонента • цитоплазма • P-body • клітинне ядро Біологічний процес • negative regulation of transposition • вроджений імунітет • defense response to virus • DNA cytosine deamination • negative regulation of viral process • negative regulation of single stranded viral RNA replication via double stranded DNA intermediate • процес імунної системи • cytidine deamination • cytidine to uridine editing • DNA demethylation Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	164668	н/д
Ensembl	ENSG00000100298	н/д
UniProt	Q6NTF7	н/д
RefSeq (мРНК)	NM_001166002 NM_001166003 NM_001166004 NM_181773	н/д
RefSeq (білок)	NP_001159474 NP_001159475 NP_001159476 NP_861438	н/д
Локус (UCSC)	Хр. 22: 39.1 – 39.1 Mb	н/д
PubMed search		н/д
Вікідані
Див./Ред. для людей

APOBEC3H (англ. Apolipoprotein B mRNA editing enzyme catalytic subunit 3H) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 22-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 200 амінокислот, а молекулярна маса — 23 531.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MALLTAETFR		LQFNNKRRLR		RPYYPRKALL		CYQLTPQNGS		TPTRGYFENK
KKCHAEICFI		NEIKSMGLDE		TQCYQVTCYL		TWSPCSSCAW		ELVDFIKAHD
HLNLGIFASR		LYYHWCKPQQ		KGLRLLCGSQ		VPVEVMGFPK		FADCWENFVD
HEKPLSFNPY		KMLEELDKNS		RAIKRRLERI		KIPGVRAQGR		YMDILCDAEV

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до гідролаз. Задіяний у таких біологічних процесах як імунітет, вроджений імунітет, антивірусний захист. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

• Harari A., Ooms M., Mulder L.C., Simon V. (2009). Polymorphisms and splice variants influence the antiretroviral activity of human APOBEC3H. J. Virol. 83: 295—303. PMID 18945781 doi:10.1128/JVI.01665-08
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
• Wedekind J.E., Dance G.S.C., Sowden M.P., Smith H.C. (2003). Messenger RNA editing in mammals: new members of the APOBEC family seeking roles in the family business. Trends Genet. 19: 207—216. PMID 12683974 doi:10.1016/S0168-9525(03)00054-4
• OhAinle M., Kerns J.A., Malik H.S., Emerman M. (2006). Adaptive evolution and antiviral activity of the conserved mammalian cytidine deaminase APOBEC3H. J. Virol. 80: 3853—3862. PMID 16571802 doi:10.1128/JVI.80.8.3853-3862.2006
• Dang Y., Wang X., Esselman W.J., Zheng Y.-H. (2006). Identification of APOBEC3DE as another antiretroviral factor from the human APOBEC family. J. Virol. 80: 10522—10533. PMID 16920826 doi:10.1128/JVI.01123-06
• Chiu Y.L., Greene W.C. (2008). The APOBEC3 cytidine deaminases: an innate defensive network opposing exogenous retroviruses and endogenous retroelements. Annu. Rev. Immunol. 26: 317—353. PMID 18304004 doi:10.1146/annurev.immunol.26.021607.090350

Див. також

• Хромосома 22