AQR

AQR
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 4PJ3
Ідентифікатори
Символи	AQR, IBP160, fSAP164, aquarius intron-binding spliceosomal factor
Зовнішні ІД	OMIM: 610548 MGI: 1276102 HomoloGene: 7629 GeneCards: AQR
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • RNA binding • nucleotide binding • mRNA binding • GO:0008026 helicase activity • ATP binding • hydrolase activity Клітинна компонента • клітинне ядро • spliceosomal complex • мембрана • catalytic step 2 spliceosome • нуклеоплазма • U2-type catalytic step 2 spliceosome Біологічний процес • Сплайсинг РНК • transcription-coupled nucleotide-excision repair • mRNA processing • mRNA splicing, via spliceosome Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	9716	11834
Ensembl	ENSG00000021776	ENSMUSG00000040383
UniProt	O60306	Q8CFQ3
RefSeq (мРНК)	NM_014691	NM_001290788 NM_009702
RefSeq (білок)	NP_055506	NP_001277717 NP_033832
Локус (UCSC)	Хр. 15: 34.85 – 34.97 Mb	Хр. 2: 113.93 – 114.02 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

AQR (англ. Aquarius intron-binding spliceosomal factor) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 15-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 485 амінокислот, а молекулярна маса — 171 295.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MAAPAQPKKI		VAPTVSQINA		EFVTQLACKY		WAPHIKKKSP		FDIKVIEDIY
EKEIVKSRFA		IRKIMLLEFS		QYLENYLWMN		YSPEVSSKAY		LMSICCMVNE
KFRENVPAWE		IFKKKPDHFP		FFFKHILKAA		LAETDGEFSL		HEQTVLLLFL
DHCFNSLEVD		LIRSQVQQLI		SLPMWMGLQL		ARLELELKKT		PKLRKFWNLI
KKNDEKMDPE		AREQAYQERR		FLSQLIQKFI		SVLKSVPLSE		PVTMDKVHYC
ERFIELMIDL		EALLPTRRWF		NTILDDSHLL		VHCYLSNLVR		REEDGHLFSQ
LLDMLKFYTG		FEINDQTGNA		LTENEMTTIH		YDRITSLQRA		AFAHFPELYD
FALSNVAEVD		TRESLVKFFG		PLSSNTLHQV		ASYLCLLPTL		PKNEDTTFDK
EFLLELLVSR		HERRISQIQQ		LNQMPLYPTE		KIIWDENIVP		TEYYSGEGCL
ALPKLNLQFL		TLHDYLLRNF		NLFRLESTYE		IRQDIEDSVS		RMKPWQSEYG
GVVFGGWARM		AQPIVAFTVV		EVAKPNIGEN		WPTRVRADVT		INLNVRDHIK
DEWEGLRKHD		VCFLITVRPT		KPYGTKFDRR		RPFIEQVGLV		YVRGCEIQGM
LDDKGRVIED		GPEPRPNLRG		ESRTFRVFLD		PNQYQQDMTN		TIQNGAEDVY
ETFNIIMRRK		PKENNFKAVL		ETIRNLMNTD		CVVPDWLHDI		ILGYGDPSSA
HYSKMPNQIA		TLDFNDTFLS		IEHLKASFPG		HNVKVTVEDP		ALQIPPFRIT
FPVRSGKGKK		RKDADVEDED		TEEAKTLIVE		PHVIPNRGPY		PYNQPKRNTI
QFTHTQIEAI		RAGMQPGLTM		VVGPPGTGKT		DVAVQIISNI		YHNFPEQRTL
IVTHSNQALN		QLFEKIMALD		IDERHLLRLG		HGEEELETEK		DFSRYGRVNY
VLARRIELLE		EVKRLQKSLG		VPGDASYTCE		TAGYFFLYQV		MSRWEEYISK
VKNKGSTLPD		VTEVSTFFPF		HEYFANAPQP		IFKGRSYEED		MEIAEGCFRH
IKKIFTQLEE		FRASELLRSG		LDRSKYLLVK		EAKIIAMTCT		HAALKRHDLV
KLGFKYDNIL		MEEAAQILEI		ETFIPLLLQN		PQDGFSRLKR		WIMIGDHHQL
PPVIKNMAFQ		KYSNMEQSLF		TRFVRVGVPT		VDLDAQGRAR		ASLCNLYNWR
YKNLGNLPHV		QLLPEFSTAN		AGLLYDFQLI		NVEDFQGVGE		SEPNPYFYQN
LGEAEYVVAL		FMYMCLLGYP		ADKISILTTY		NGQKHLIRDI		INRRCGNNPL
IGRPNKVTTV		DRFQGQQNDY		ILLSLVRTRA		VGHLRDVRRL		VVAMSRARLG
LYIFARVSLF		QNCFELTPAF		SQLTARPLHL		HIIPTEPFPT		TRKNGERPSH
EVQIIKNMPQ		MANFVYNMYM		HLIQTTHHYH		QTLLQLPPAM		VEEGEEVQNQ
ETELETEEEA		MTVQADIIPS		PTDTSCRQET		PAFQTDTTPS		ETGATSTPEA
IPALSETTPT		VVGAVSAPAE		ANTPQDATSA		PEETK

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах, як процесинг мРНК, сплайсинг мРНК, ацетилювання. Білок має сайт для зв'язування з РНК. Локалізований у ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Jurica M.S., Licklider L.J., Gygi S.P., Grigorieff N., Moore M.J. (2002). Purification and characterization of native spliceosomes suitable for three-dimensional structural analysis. RNA. 8: 426—439. PMID 11991638 DOI:10.1017/S1355838202021088

Див. також

• Хромосома 15