ARFGAP1

ARFGAP1
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 3O47, 3DWD
Ідентифікатори
Символи	ARFGAP1, ARF1GAP, HRIHFB2281, ADP ribosylation factor GTPase activating protein 1
Зовнішні ІД	OMIM: 608377 MGI: 2183559 HomoloGene: 5517 GeneCards: ARFGAP1
Онтологія гена Молекулярна функція • зв'язування з іоном металу • GO:0005097, GO:0005099, GO:0005100 GTPase activator activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding Клітинна компонента • цитоплазма • синапс • комплекс Ґольджі • гіалоплазма • GO:0097483, GO:0097481 постсинаптичне ущільнення • Golgi membrane Біологічний процес • endoplasmic reticulum to Golgi vesicle-mediated transport • regulation of endocytosis • IRE1-mediated unfolded protein response • retrograde vesicle-mediated transport, Golgi to endoplasmic reticulum • protein transport • vesicle-mediated transport • GO:0032320, GO:0032321, GO:0032855, GO:0043089, GO:0032854 positive regulation of GTPase activity • regulation of ARF protein signal transduction Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	55738	228998
Ensembl	ENSG00000101199	ENSMUSG00000027575
UniProt	Q8N6T3	Q9EPJ9
RefSeq (мРНК)	NM_001281482 NM_001281483 NM_001281484 NM_018209 NM_175609	NM_001177706 NM_001177707 NM_001177708 NM_001177709 NM_001177710 NM_145760 NM_001363035 NM_001363036 NM_001363037 NM_001374670
RefSeq (білок)	NP_001268411 NP_001268412 NP_001268413 NP_060679 NP_783202	NP_001171177 NP_001171178 NP_001171179 NP_001171180 NP_001171181 NP_665703 NP_001349964 NP_001349965 NP_001349966 NP_001361599
Локус (UCSC)	Хр. 20: 63.27 – 63.29 Mb	Хр. 2: 180.61 – 180.62 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

ARFGAP1 (англ. ADP ribosylation factor GTPase activating protein 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 20-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 406 амінокислот, а молекулярна маса — 44 668.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MASPRTRKVL		KEVRVQDENN		VCFECGAFNP		QWVSVTYGIW		ICLECSGRHR
GLGVHLSFVR		SVTMDKWKDI		ELEKMKAGGN		AKFREFLESQ		EDYDPCWSLQ
EKYNSRAAAL		FRDKVVALAE		GREWSLESSP		AQNWTPPQPR		TLPSMVHRVS
GQPQSVTASS		DKAFEDWLND		DLGSYQGAQG		NRYVGFGNTP		PPQKKEDDFL
NNAMSSLYSG		WSSFTTGASR		FASAAKEGAT		KFGSQASQKA		SELGHSLNEN
VLKPAQEKVK		EGKIFDDVSS		GVSQLASKVQ		GVGSKGWRDV		TTFFSGKAEG
PLDSPSEGHS		YQNSGLDHFQ		NSNIDQSFWE		TFGSAEPTKT		RKSPSSDSWT
CADTSTERRS		SDSWEVWGSA		STNRNSNSDG		GEGGEGTKKA		VPPAVPTDDG
WDNQNW

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до активаторів гтфаз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транспорт, транспорт білків, транспорт між ендоплазматичним ретикулумом і апаратом Гольджі, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у цитоплазмі, апараті гольджі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Beausoleil S.A., Villen J., Gerber S.A., Rush J., Gygi S.P. (2006). A probability-based approach for high-throughput protein phosphorylation analysis and site localization. Nat. Biotechnol. 24: 1285—1292. PMID 16964243 DOI:10.1038/nbt1240

Див. також

• Хромосома 20