ARHGEF4

ARHGEF4
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2DX1, 2PZ1, 3NMX, 3NMZ
Ідентифікатори
Символи	ARHGEF4, ASEF, ASEF1, GEF4, STM6, Rho guanine nucleotide exchange factor 4, SMIM39
Зовнішні ІД	OMIM: 605216 MGI: 2442507 HomoloGene: 49414 GeneCards: ARHGEF4
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • protein domain specific binding • guanyl-nucleotide exchange factor activity Клітинна компонента • цитоплазма • ruffle membrane • гіалоплазма • клітинна мембрана • cell projection • мембрана Біологічний процес • filopodium assembly • regulation of Rho protein signal transduction • GO:0007243 intracellular signal transduction • regulation of small GTPase mediated signal transduction • lamellipodium assembly • positive regulation of apoptotic process • G protein-coupled receptor signaling pathway Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	50649	226970
Ensembl	ENSG00000136002	ENSMUSG00000037509
UniProt	Q9NR80	Q7TNR9
RefSeq (мРНК)	NM_015320 NM_032995 NM_001367493 NM_001375900 NM_001375901 NM_001375902 NM_001375903 NM_001375904 NM_001395416	NM_183019 NM_001368773
RefSeq (білок)	NP_056135 NP_001354422 NP_001362829 NP_001362830 NP_001362831 NP_001362832 NP_001362833	NP_898840 NP_001355702
Локус (UCSC)	Хр. 2: 130.84 – 131.05 Mb	Хр. 1: 34.68 – 34.81 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

ARHGEF4 (англ. Rho guanine nucleotide exchange factor 4) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 690 амінокислот, а молекулярна маса — 79 067.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MPWEEPAGEK		PSCSHSQKAF		HMEPAQKPCF		TTDMVTWALL		CISAETVRGE
APSQPRGIPH		RSPVSVDDLW		LEKTQRKKLQ		KQAHVERRLH		IGAVHKDGVK
CWRKTIITSP		ESLNLPRRSH		PLSQSAPTGL		NHMGWPEHTP		GTAMPDGALD
TAVCADEVGS		EEDLYDDLHS		SSHHYSHPGG		GGEQLAINEL		ISDGSVVCAE
ALWDHVTMDD		QELGFKAGDV		IEVMDATNRE		WWWGRVADGE		GWFPASFVRL
RVNQDEPADD		DAPLAGNSGA		EDGGAEAQSS		KDQMRTNVIN		EILSTERDYI
KHLRDICEGY		VRQCRKRADM		FSEEQLRTIF		GNIEDIYRCQ		KAFVKALEQR
FNRERPHLSE		LGACFLEHQA		DFQIYSEYCN		NHPNACVELS		RLTKLSKYVY
FFEACRLLQK		MIDISLDGFL		LTPVQKICKY		PLQLAELLKY		THPQHRDFKD
VEAALHAMKN		VAQLINERKR		RLENIDKIAQ		WQSSIEDWEG		EDLLVRSSEL
IYSGELTRVT		QPQAKSQQRM		FFLFDHQLIY		CKKDLLRRDV		LYYKGRLDMD
GLEVVDLEDG		KDRDLHVSIK		NAFRLHRGAT		GDSHLLCTRK		PEQKQRWLKA
FAREREQVQL		DQETGFSITE		LQRKQAMLNA		SKQQVTGKPK		AVGRPCYLTR
QKHPALPSNR		PQQQVLVLAE		PRRKPSTFWH		SISRLAPFRK

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах як поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, мембрані, клітинних відростках.

Література

• Thiesen S., Kuebart S., Ropers H.-H., Nothwang H.G. (2000). Isolation of two novel human RhoGEFs, ARHGEF3 and ARHGEF4, in 3p13-21 and 2q22. Biochem. Biophys. Res. Commun. 273: 364—369. PMID 10873612 DOI:10.1006/bbrc.2000.2925
• Kawasaki Y., Sato R., Akiyama T. (2003). Mutated APC and Asef are involved in the migration of colorectal tumour cells. Nat. Cell Biol. 5: 211—215. PMID 12598901 DOI:10.1038/ncb937
• Hamann M.J., Lubking C.M., Luchini D.N., Billadeau D.D. (2007). Asef2 functions as a Cdc42 exchange factor and is stimulated by the release of an autoinhibitory module from a concealed C-terminal activation element. Mol. Cell. Biol. 27: 1380—1393. PMID 17145773 DOI:10.1128/MCB.01608-06

Див. також

• Хромосома 2