ASCC3

ASCC3
Ідентифікатори
Символи	ASCC3, ASC1p200, HELIC1, RNAH, activating signal cointegrator 1 complex subunit 3
Зовнішні ІД	OMIM: 614217 MGI: 1925237 HomoloGene: 4973 GeneCards: ASCC3
Онтологія гена Молекулярна функція • nucleotide binding • GO:0043140 3'-5' DNA helicase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • hydrolase activity • ATP binding • GO:0008026 helicase activity • nucleic acid binding • RNA binding Клітинна компонента • внутрішньоклітинний • мембрана • нуклеоплазма • клітинне ядро • гіалоплазма • activating signal cointegrator 1 complex • nuclear speck • цитоплазма • комплекс Ґольджі Біологічний процес • DNA dealkylation involved in DNA repair • DNA duplex unwinding • проліферація • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription, DNA-templated • cellular response to DNA damage stimulus • GO:0100026 Репарація ДНК Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	10973	77987
Ensembl	ENSG00000112249	ENSMUSG00000038774
UniProt	Q8N3C0	E9PZJ8
RefSeq (мРНК)	NM_001284271 NM_006828 NM_022091	NM_198007
RefSeq (білок)	NP_001271200 NP_006819 NP_071374	NP_932124
Локус (UCSC)	Хр. 6: 100.51 – 100.88 Mb	Хр. 10: 50.47 – 50.73 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

ASCC3 (англ. Activating signal cointegrator 1 complex subunit 3) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 2 202 амінокислот, а молекулярна маса — 251 460.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MALPRLTGAL		RSFSNVTKQD		NYNEEVADLK		IKRSKLHEQV		LDLGLTWKKI
IKFLNEKLEK		SKMQSINEDL		KDILHAAKQI		VGTDNGREAI		ESGAAFLFMT
FHLKDSVGHK		ETKAIKQMFG		PFPSSSATAA		CNATNRIISH		FSQDDLTALV
QMTEKEHGDR		VFFGKNLAFS		FDMHDLDHFD		ELPINGETQK		TISLDYKKFL
NEHLQEACTP		ELKPVEKTNG		SFLWCEVEKY		LNSTLKEMTE		VPRVEDLCCT
LYDMLASIKS		GDELQDELFE		LLGPEGLELI		EKLLQNRITI		VDRFLNSSND
HRFQALQDNC		KKILGENAKP		NYGCQVTIQS		EQEKQLMKQY		RREEKRIARR
EKKAGEDLEV		SEGLMCFDPK		ELRIQREQAL		LNARSVPILS		RQRDADVEKI
HYPHVYDSQA		EAMKTSAFIA		GAKMILPEGI		QRENNKLYEE		VRIPYSEPMP
LSFEEKPVYI		QDLDEIGQLA		FKGMKRLNRI		QSIVFETAYN		TNENMLICAP
TGAGKTNIAM		LTVLHEIRQH		FQQGVIKKNE		FKIVYVAPMK		ALAAEMTDYF
SRRLEPLGII		VKELTGDMQL		SKSEILRTQM		LVTTPEKWDV		VTRKSVGDVA
LSQIVRLLIL		DEVHLLHEDR		GPVLESIVAR		TLRQVESTQS		MIRILGLSAT
LPNYLDVATF		LHVNPYIGLF		FFDGRFRPVP		LGQTFLGIKC		ANKMQQLNNM
DEVCYENVLK		QVKAGHQVMV		FVHARNATVR		TAMSLIERAK		NCGHIPFFFP
TQGHDYVLAE		KQVQRSRNKQ		VRELFPDGFS		IHHAGMLRQD		RNLVENLFSN
GHIKVLVCTA		TLAWGVNLPA		HAVIIKGTQI		YAAKRGSFVD		LGILDVMQIF
GRAGRPQFDK		FGEGIIITTH		DKLSHYLTLL		TQRNPIESQF		LESLADNLNA
EIALGTVTNV		EEAVKWISYT		YLYVRMRANP		LAYGISHKAY		QIDPTLRKHR
EQLVIEVGRK		LDKAQMIRFE		ERTGYFSSTD		LGRTASHYYI		KYNTIETFNE
LFDAHKTEGD		IFAIVSKAEE		FDQIKVREEE		IEELDTLLSN		FCELSTPGGV
ENSYGKINIL		LQTYISRGEM		DSFSLISDSA		YVAQNAARIV		RALFEIALRK
RWPTMTYRLL		NLSKVIDKRL		WGWASPLRQF		SILPPHILTR		LEEKKLTVDK
LKDMRKDEIG		HILHHVNIGL		KVKQCVHQIP		SVMMEASIQP		ITRTVLRVTL
SIYADFTWND		QVHGTVGEPW		WIWVEDPTND		HIYHSEYFLA		LKKQVISKEA
QLLVFTIPIF		EPLPSQYYIR		AVSDRWLGAE		AVCIINFQHL		ILPERHPPHT
ELLDLQPLPI		TALGCKAYEA		LYNFSHFNPV		QTQIFHTLYH		TDCNVLLGAP
TGSGKTVAAE		LAIFRVFNKY		PTSKAVYIAP		LKALVRERMD		DWKVRIEEKL
GKKVIELTGD		VTPDMKSIAK		ADLIVTTPEK		WDGVSRSWQN		RNYVQQVTIL
IIDEIHLLGE		ERGPVLEVIV		SRTNFISSHT		EKPVRIVGLS		TALANARDLA
DWLNIKQMGL		FNFRPSVRPV		PLEVHIQGFP		GQHYCPRMAS		MNKPAFQAIR
SHSPAKPVLI		FVSSRRQTRL		TALELIAFLA		TEEDPKQWLN		MDEREMENII
ATVRDSNLKL		TLAFGIGMHH		AGLHERDRKT		VEELFVNCKV		QVLIATSTLA
WGVNFPAHLV		IIKGTEYYDG		KTRRYVDFPI		TDVLQMMGRA		GRPQFDDQGK
AVILVHDIKK		DFYKKFLYEP		FPVESSLLGV		LSDHLNAEIA		GGTITSKQDA
LDYITWTYFF		RRLIMNPSYY		NLGDVSHDSV		NKFLSHLIEK		SLIELELSYC
IEIGEDNRSI		EPLTYGRIAS		YYYLKHQTVK		MFKDRLKPEC		STEELLSILS
DAEEYTDLPV		RHNEDHMNSE		LAKCLPIESN		PHSFDSPHTK		AHLLLQAHLS
RAMLPCPDYD		TDTKTVLDQA		LRVCQAMLDV		AANQGWLVTV		LNITNLIQMV
IQGRWLKDSS		LLTLPNIENH		HLHLFKKWKP		IMKGPHARGR		TSIESLPELI
HACGGKDHVF		SSMVESELHA		AKTKQAWNFL		SHLPVINVGI		SVKGSWDDLV
EGHNELSVST		LTADKRDDNK		WIKLHADQEY		VLQVSLQRVH		FGFHKGKPES
CAVTPRFPKS		KDEGWFLILG		EVDKRELIAL		KRVGYIRNHH		VASLSFYTPE
IPGRYIYTLY		FMSDCYLGLD		QQYDIYLNVT		QASLSAQVNT		KVSDSLTDLA
LK

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, геліказ, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, пошкодження ДНК, репарація ДНК, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами. Локалізований у ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 6