ASPSCR1

ASPSCR1
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2AL3
Ідентифікатори
Символи	ASPSCR1, ASPCR1, ASPL, ASPS, RCC17, TUG, UBXD9, UBXN9, alveolar soft part sarcoma chromosome region, candidate 1, UBX domain containing tether for SLC2A4, ASPSCR1 tether for SLC2A4, UBX domain containing
Зовнішні ІД	OMIM: 606236 MGI: 1916188 HomoloGene: 41550 GeneCards: ASPSCR1
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding Клітинна компонента • extrinsic component of membrane • цитоплазма • perinuclear region of cytoplasm • мембрана • гіалоплазма • cytoplasmic side of plasma membrane • клітинна мембрана • endoplasmic reticulum-Golgi intermediate compartment membrane • внутрішньоклітинна мембранна органела • система ендомембран • клітинне ядро • нуклеоплазма • vesicle membrane Біологічний процес • intracellular protein transport • glucose homeostasis • regulation of glucose import • positive regulation of protein modification process Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	79058	68938
Ensembl	ENSG00000169696	ENSMUSG00000025142
UniProt	Q9BZE9	Q8VBT9
RefSeq (мРНК)	NM_001251888 NM_024083 NM_001330528	NM_001164224 NM_026877 NM_198223 NM_001363055 NM_001363056
RefSeq (білок)	NP_001238817 NP_001317457 NP_076988	NP_001157696 NP_081153 NP_937866 NP_001349984 NP_001349985
Локус (UCSC)	Хр. 17: 81.98 – 82.02 Mb	Хр. 11: 120.56 – 120.6 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

ASPSCR1 (англ. ASPSCR1, UBX domain containing tether for SLC2A4) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 17-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 553 амінокислот, а молекулярна маса — 60 183.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MAAPAGGGGS		AVSVLAPNGR		RHTVKVTPST		VLLQVLEDTC		RRQDFNPCEY
DLKFQRSVLD		LSLQWRFANL		PNNAKLEMVP		ASRSREGPEN		MVRIALQLDD
GSRLQDSFCS		GQTLWELLSH		FPQIRECLQH		PGGATPVCVY		TRDEVTGEAA
LRGTTLQSLG		LTGGSATIRF		VMKCYDPVGK		TPGSLGSSAS		AGQAAASAPL
PLESGELSRG		DLSRPEDADT		SGPCCEHTQE		KQSTRAPAAA		PFVPFSGGGQ
RLGGPPGPTR		PLTSSSAKLP		KSLSSPGGPS		KPKKSKSGQD		PQQEQEQERE
RDPQQEQERE		RPVDREPVDR		EPVVCHPDLE		ERLQAWPAEL		PDEFFELTVD
DVRRRLAQLK		SERKRLEEAP		LVTKAFREAQ		IKEKLERYPK		VALRVLFPDR
YVLQGFFRPS		ETVGDLRDFV		RSHLGNPELS		FYLFITPPKT		VLDDHTQTLF
QANLFPAALV		HLGAEEPAGV		YLEPGLLEHA		ISPSAADVLV		ARYMSRAAGS
PSPLPAPDPA		PKSEPAAEEG		ALVPPEPIPG		TAQPVKRSLG		KVPKWLKLPA
SKR

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі, ядрі, мембрані.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
• Orme C.M., Bogan J.S. (2012). The ubiquitin regulatory X (UBX) domain-containing protein TUG regulates the p97 ATPase and resides at the endoplasmic reticulum-golgi intermediate compartment. J. Biol. Chem. 287: 6679—6692. PMID 22207755 doi:10.1074/jbc.M111.284232
• Cloutier P., Lavallee-Adam M., Faubert D., Blanchette M., Coulombe B. (2013). A newly uncovered group of distantly related lysine methyltransferases preferentially interact with molecular chaperones to regulate their activity. PLoS Genet. 9: E1003210—E1003210. PMID 23349634 doi:10.1371/journal.pgen.1003210

Див. також

• Хромосома 17