ATF7IP

ATF7IP
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2RPQ
Ідентифікатори
Символи	ATF7IP, AM, ATF-IP, MCAF, MCAF1, p621, activating transcription factor 7 interacting protein
Зовнішні ІД	OMIM: 613644 MGI: 1858965 HomoloGene: 10051 GeneCards: ATF7IP
Пов'язані генетичні захворювання
testicular germ cell tumor
Онтологія гена Молекулярна функція • ATPase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • GO:0001106 transcription corepressor activity Клітинна компонента • клітинне ядро • transcription regulator complex • нуклеоплазма • гіалоплазма • ядерні тільця Біологічний процес • GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated • Метилювання ДНК • regulation of RNA polymerase II transcription preinitiation complex assembly • GO:0022415 viral process • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • transcription, DNA-templated • regulation of protein stability • protein stabilization • positive regulation of DNA methylation-dependent heterochromatin assembly Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	55729	54343
Ensembl	ENSG00000171681	ENSMUSG00000030213
UniProt	Q6VMQ6	Q7TT18
RefSeq (мРНК)	NM_001286514 NM_001286515 NM_018179 NM_181352	NM_019426
RefSeq (білок)	NP_001273443 NP_001273444 NP_060649 NP_851997 NP_060649.3	NP_062299 NP_001375123 NP_001375124 NP_001375125 NP_001375126
Локус (UCSC)	Хр. 12: 14.37 – 14.5 Mb	Хр. 6: 136.51 – 136.61 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

ATF7IP (англ. Activating transcription factor 7 interacting protein) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 12-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 270 амінокислот, а молекулярна маса — 136 394.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MDSLEEPQKK		VFKARKTMRV		SDRQQLEAVY		KVKEELLKTD		VKLLNGNHEN
GDLDPTSPLE		NMDYIKDKEE		VNGIEEICFD		PEGSKAEWKE		TPCILSVNVK
NKQDDDLNCE		PLSPHNITPE		PVSKLPAEPV		SGDPAPGDLD		AGDPASGVLA
SGDSTSGDPT		SSEPSSSDAA		SGDATSGDAP		SGDVSPGDAT		SGDATADDLS
SGDPTSSDPI		PGEPVPVEPI		SGDCAADDIA		SSEITSVDLA		SGAPASTDPA
SDDLASGDLS		SSELASDDLA		TGELASDELT		SESTFDRTFE		PKSVPVCEPV
PEIDNIEPSS		NKDDDFLEKN		GADEKLEQIQ		SKDSLDEKNK		ADNNIDANEE
TLETDDTTIC		SDRPPENEKK		VEEDIITELA		LGEDAISSSM		EIDQGEKNED
ETSADLVETI		NENVIEDNKS		ENILENTDSM		ETDEIIPILE		KLAPSEDELT
CFSKTSLLPI		DETNPDLEEK		MESSFGSPSK		QESSESLPKE		AFLVLSDEED
ISGEKDESEV		ISQNETCSPA		EVESNEKDNK		PEEEEQVIHE		DDERPSEKNE
FSRRKRSKSE		DMDNVQSKRR		RYMEEEYEAE		FQVKITAKGD		INQKLQKVIQ
WLLEEKLCAL		QCAVFDKTLA		ELKTRVEKIE		CNKRHKTVLT		ELQAKIARLT
KRFEAAKEDL		KKRHEHPPNP		PVSPGKTVND		VNSNNNMSYR		NAGTVRQMLE
SKRNVSESAP		PSFQTPVNTV		SSTNLVTPPA		VVSSQPKLQT		PVTSGSLTAT
SVLPAPNTAT		VVATTQVPSG		NPQPTISLQP		LPVILHVPVA		VSSQPQLLQS
HPGTLVTNQP		SGNVEFISVQ		SPPTVSGLTK		NPVSLPSLPN		PTKPNNVPSV
PSPSIQRNPT		ASAAPLGTTL		AVQAVPTAHS		IVQATRTSLP		TVGPSGLYSP
STNRGPIQMK		IPISAFSTSS		AAEQNSNTTP		RIENQTNKTI		DASVSKKAAD
STSQCGKATG		SDSSGVIDLT		MDDEESGASQ		DPKKLNHTPV		STMSSSQPVS
RPLQPIQPAP		PLQPSGVPTS		GPSQTTIHLL		PTAPTTVNVT		HRPVTQVTTR
LPVPRAPANH		QVVYTTLPAP		PAQAPLRGTV		MQAPAVRQVN		PQNSVTVRVP
QTTTYVVNNG		LTLGSTGPQL		TVHHRPPQVH		TEPPRPVHPA		PLPEAPQPQR
LPPEAASTSL		PQKPHLKLAR		VQSQNGIVLS		WSVLEVDRSC		ATVDSYHLYA
YHEEPSATVP		SQWKKIGEVK		ALPLPMACTL		TQFVSGSKYY		FAVRAKDIYG
RFGPFCDPQS		TDVISSTQSS

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, активаторів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як взаємодія хазяїн-вірус, транскрипція, регуляція транскрипції, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Локалізований у ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Gunther M., Laithier M., Brison O. (2000). A set of proteins interacting with transcription factor Sp1 identified in a two-hybrid screening. Mol. Cell. Biochem. 210: 131—142. PMID 10976766 DOI:10.1023/A:1007177623283
• Beausoleil S.A., Villen J., Gerber S.A., Rush J., Gygi S.P. (2006). A probability-based approach for high-throughput protein phosphorylation analysis and site localization. Nat. Biotechnol. 24: 1285—1292. PMID 16964243 DOI:10.1038/nbt1240

Див. також

• Хромосома 12