ATG4A

ATG4A
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2P82
Ідентифікатори
Символи	ATG4A, APG4A, AUTL2, autophagy related 4A cysteine peptidase, HsAPG4A
Зовнішні ІД	OMIM: 300663 MGI: 2147903 HomoloGene: 70873 GeneCards: ATG4A
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0070122 peptidase activity • cysteine-type peptidase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • hydrolase activity • cysteine-type endopeptidase activity Клітинна компонента • цитоплазма • гіалоплазма Біологічний процес • автофагія • protein transport • autophagy of nucleus • C-terminal protein lipidation • protein delipidation • autophagy of mitochondrion • autophagosome assembly • протеоліз • protein targeting to membrane Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	115201	666468
Ensembl	ENSG00000101844	ENSMUSG00000079418
UniProt	Q8WYN0	Q8C9S8
RefSeq (мРНК)	NM_052936 NM_178270 NM_178271 NM_001321287 NM_001321288 NM_001321289 NM_001321290	NM_174875
RefSeq (білок)	NP_001308216 NP_001308217 NP_001308218 NP_001308219 NP_443168 NP_840054 NP_840055	NP_777364 NP_001366610 NP_001366611 NP_001366612 NP_001366613
Локус (UCSC)	Хр. X: 108.09 – 108.15 Mb	Хр. X: 140.96 – 141.16 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

ATG4A (англ. Autophagy related 4A cysteine peptidase) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на X-хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 398 амінокислот, а молекулярна маса — 45 378.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MESVLSKYED		QITIFTDYLE		EYPDTDELVW		ILGKQHLLKT		EKSKLLSDIS
ARLWFTYRRK		FSPIGGTGPS		SDAGWGCMLR		CGQMMLAQAL		ICRHLGRDWS
WEKQKEQPKE		YQRILQCFLD		RKDCCYSIHQ		MAQMGVGEGK		SIGEWFGPNT
VAQVLKKLAL		FDEWNSLAVY		VSMDNTVVIE		DIKKMCRVLP		LSADTAGDRP
PDSLTASNQS		KGTSAYCSAW		KPLLLIVPLR		LGINQINPVY		VDAFKECFKM
PQSLGALGGK		PNNAYYFIGF		LGDELIFLDP		HTTQTFVDTE		ENGTVNDQTF
HCLQSPQRMN		ILNLDPSVAL		GFFCKEEKDF		DNWCSLVQKE		ILKENLRMFE
LVQKHPSHWP		PFVPPAKPEV		TTTGAEFIDS		TEQLEEFDLE		EDFEILSV

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, протеаз, тіолових протеаз. Задіяний у таких біологічних процесах, як транспорт, транспорт білків, убіквітинування білків, автофагія, альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Scherz-Shouval R., Sagiv Y., Shorer H., Elazar Z. (2003). The COOH terminus of GATE-16, an intra-Golgi transport modulator, is cleaved by the human cysteine protease HsApg4A. J. Biol. Chem. 278: 14053—14058. PMID 12473658 DOI:10.1074/jbc.M212108200
• Li M., Chen X., Ye Q.Z., Vogt A., Yin X.M. (2012). A high-throughput FRET-based assay for determination of Atg4 activity. Autophagy. 8: 401—412. PMID 22302004 DOI:10.4161/auto.18777

Див. також

• Хромосома X