ATG4B

ATG4B
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2CY7, 2D1I, 2Z0D, 2Z0E, 2ZZP
Ідентифікатори
Символи	ATG4B, APG4B, AUTL1, autophagy related 4B cysteine peptidase, HsAPG4B
Зовнішні ІД	OMIM: 611338 MGI: 1913865 HomoloGene: 100868 GeneCards: ATG4B
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0070122 peptidase activity • cysteine-type peptidase activity • endopeptidase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • hydrolase activity • cysteine-type endopeptidase activity Клітинна компонента • цитоплазма • гіалоплазма Біологічний процес • автофагія • protein transport • autophagy of nucleus • C-terminal protein lipidation • GO:1903364 positive regulation of protein catabolic process • autophagy of mitochondrion • autophagosome assembly • macroautophagy • протеоліз • protein targeting to membrane • protein delipidation Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	23192	66615
Ensembl	ENSG00000168397	н/д
UniProt	Q9Y4P1	Q8BGE6
RefSeq (мРНК)	NM_013325 NM_178326	NM_174874 NM_001368266
RefSeq (білок)	NP_037457 NP_847896	NP_777363 NP_001355195
Локус (UCSC)	Хр. 2: 241.64 – 241.67 Mb	н/д
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

ATG4B (англ. Autophagy related 4B cysteine peptidase) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 393 амінокислот, а молекулярна маса — 44 294.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MDAATLTYDT		LRFAEFEDFP		ETSEPVWILG		RKYSIFTEKD		EILSDVASRL
WFTYRKNFPA		IGGTGPTSDT		GWGCMLRCGQ		MIFAQALVCR		HLGRDWRWTQ
RKRQPDSYFS		VLNAFIDRKD		SYYSIHQIAQ		MGVGEGKSIG		QWYGPNTVAQ
VLKKLAVFDT		WSSLAVHIAM		DNTVVMEEIR		RLCRTSVPCA		GATAFPADSD
RHCNGFPAGA		EVTNRPSPWR		PLVLLIPLRL		GLTDINEAYV		ETLKHCFMMP
QSLGVIGGKP		NSAHYFIGYV		GEELIYLDPH		TTQPAVEPTD		GCFIPDESFH
CQHPPCRMSI		AELDPSIAVG		FFCKTEDDFN		DWCQQVKKLS		LLGGALPMFE
LVELQPSHLA		CPDVLNLSLD		SSDVERLERF		FDSEDEDFEI		LSL

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, протеаз, тіолових протеаз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як транспорт, транспорт білків, убіквітинування білків, автофагія, поліморфізм, ацетиляція, альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
• Li M., Chen X., Ye Q.Z., Vogt A., Yin X.M. (2012). A high-throughput FRET-based assay for determination of Atg4 activity. Autophagy. 8: 401—412. PMID 22302004 doi:10.4161/auto.18777

Див. також

• Хромосома 2