ATOH8

ATOH8
Ідентифікатори
Символи	ATOH8, HATH6, bHLHa21, atonal bHLH transcription factor 8
Зовнішні ІД	MGI: 1918343 HomoloGene: 41893 GeneCards: ATOH8
Онтологія гена Молекулярна функція • DNA binding • protein dimerization activity • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • transcription factor binding • E-box binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific Клітинна компонента • цитоплазма • nuclear speck • клітинне ядро • нуклеоплазма Біологічний процес • диференціація клітин • positive regulation of endothelial cell differentiation • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • SMAD protein signal transduction • transcription, DNA-templated • нейробіологія розвитку • negative regulation of endothelial cell proliferation • positive regulation of endothelial cell migration • GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated • multicellular organism development • tube formation • myoblast proliferation • formation of primary germ layer • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • GO:1901313 positive regulation of gene expression • negative regulation of gene expression • positive regulation of pri-miRNA transcription by RNA polymerase II Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	84913	71093
Ensembl	ENSG00000168874	ENSMUSG00000037621
UniProt	Q96SQ7	Q99NA2
RefSeq (мРНК)	NM_032827	NM_153778
RefSeq (білок)	NP_116216	NP_722473
Локус (UCSC)	Хр. 2: 85.75 – 85.79 Mb	Хр. 6: 72.18 – 72.21 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

ATOH8 (англ. Atonal bHLH transcription factor 8) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 321 амінокислот, а молекулярна маса — 34 644.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MKHIPVLEDG		PWKTVCVKEL		NGLKKLKRKG		KEPARRANGY		KTFRLDLEAP
EPRAVATNGL		RDRTHRLQPV		PVPVPVPVPV		APAVPPRGGT		DTAGERGGSR
APEVSDARKR		CFALGAVGPG		LPTPPPPPPP		APQSQAPGGP		EAQPFREPGL
RPRILLCAPP		ARPAPSAPPA		PPAPPESTVR		PAPPTRPGES		SYSSISHVIY
NNHQDSSASP		RKRPGEATAA		SSEIKALQQT		RRLLANARER		TRVHTISAAF
EALRKQVPCY		SYGQKLSKLA		ILRIACNYIL		SLARLADLDY		SADHSNLSFS
ECVQRCTRTL		QAEGRAKKRK		E

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до білків розвитку. Задіяний у таких біологічних процесах як транскрипція, регуляція транскрипції, диференціація, нейрогенез, поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 2