ATRNL1

ATRNL1
Ідентифікатори
Символи	ATRNL1, ALP, bA338L11.1, bA454H24.1, attractin like 1
Зовнішні ІД	OMIM: 612869 MGI: 2147749 HomoloGene: 45809 GeneCards: ATRNL1
Онтологія гена Молекулярна функція • carbohydrate binding Клітинна компонента • мембрана • integral component of membrane Біологічний процес • G protein-coupled receptor signaling pathway • animal organ morphogenesis • гістогенез Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	26033	226255
Ensembl	ENSG00000107518	ENSMUSG00000054843
UniProt	Q5VV63	Q6A051
RefSeq (мРНК)	NM_001276282 NM_207303	NM_181415
RefSeq (білок)	NP_001263211 NP_997186	NP_852080
Локус (UCSC)	Хр. 10: 115.09 – 115.95 Mb	Хр. 19: 57.6 – 58.12 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

ATRNL1 (англ. Attractin like 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 10-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 379 амінокислот, а молекулярна маса — 152 639.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
METGGRARTG		TPQPAAPGVW		RARPAGGGGG		GASSWLLDGN		SWLLCYGFLY
LALYAQVSQS		KPCERTGSCF		SGRCVNSTCL		CDPGWVGDQC		QHCQGRFKLT
EPSGYLTDGP		INYKYKTKCT		WLIEGYPNAV		LRLRFNHFAT		ECSWDHMYVY
DGDSIYAPLI		AVLSGLIVPE		IRGNETVPEV		VTTSGYALLH		FFSDAAYNLT
GFNIFYSINS		CPNNCSGHGK		CTTSVSVPSQ		VYCECDKYWK		GEACDIPYCK
ANCGSPDHGY		CDLTGEKLCV		CNDSWQGPDC		SLNVPSTESY		WILPNVKPFS
PSVGRASHKA		VLHGKFMWVI		GGYTFNYSSF		QMVLNYNLES		SIWNVGTPSR
GPLQRYGHSL		ALYQENIFMY		GGRIETNDGN		VTDELWVFNI		HSQSWSTKTP
TVLGHGQQYA		VEGHSAHIME		LDSRDVVMII		IFGYSAIYGY		TSSIQEYHIS
SNTWLVPETK		GAIVQGGYGH		TSVYDEITKS		IYVHGGYKAL		PGNKYGLVDD
LYKYEVNTKT		WTILKESGFA		RYLHSAVLIN		GAMLIFGGNT		HNDTSLSNGA
KCFSADFLAY		DIACDEWKIL		PKPNLHRDVN		RFGHSAVVIN		GSMYIFGGFS
SVLLNDILVY		KPPNCKAFRD		EELCKNAGPG		IKCVWNKNHC		ESWESGNTNN
ILRAKCPPKT		AASDDRCYRY		ADCASCTANT		NGCQWCDDKK		CISANSNCSM
SVKNYTKCHV		RNEQICNKLT		SCKSCSLNLN		CQWDQRQQEC		QALPAHLCGE
GWSHIGDACL		RVNSSRENYD		NAKLYCYNLS		GNLASLTTSK		EVEFVLDEIQ
KYTQQKVSPW		VGLRKINISY		WGWEDMSPFT		NTTLQWLPGE		PNDSGFCAYL
ERAAVAGLKA		NPCTSMANGL		VCEKPVVSPN		QNARPCKKPC		SLRTSCSNCT
SNGMECMWCS		STKRCVDSNA		YIISFPYGQC		LEWQTATCSP		QNCSGLRTCG
QCLEQPGCGW		CNDPSNTGRG		HCIEGSSRGP		MKLIGMHHSE		MVLDTNLCPK
EKNYEWSFIQ		CPACQCNGHS		TCINNNVCEQ		CKNLTTGKQC		QDCMPGYYGD
PTNGGQCTAC		TCSGHANICH		LHTGKCFCTT		KGIKGDQCQL		CDSENRYVGN
PLRGTCYYSL		LIDYQFTFSL		LQEDDRHHTA		INFIANPEQS		NKNLDISINA
SNNFNLNITW		SVGSTAGTIS		GEETSIVSKN		NIKEYRDSFS		YEKFNFRSNP
NITFYVYVSN		FSWPIKIQIA		FSQHNTIMDL		VQFFVTFFSC		FLSLLLVAAV
VWKIKQTCWA		SRRREQLLRE		RQQMASRPFA		SVDVALEVGA		EQTEFLRGPL
EGAPKPIAIE		PCAGNRAAVL		TVFLCLPRGS		SGAPPPGQSG		LAIASALIDI
SQQKASDSKD		KTSGVRNRKH		LSTRQGTCV

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з лектинами. Локалізований у мембрані.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 10