AUP1

AUP1
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2EKF
Ідентифікатори
Символи	AUP1, ancient ubiquitous protein 1, lipid droplet regulating VLDL assembly factor, AUP1 lipid droplet regulating VLDL assembly factor
Зовнішні ІД	OMIM: 602434 MGI: 107789 HomoloGene: 7239 GeneCards: AUP1
Онтологія гена Молекулярна функція • ubiquitin binding • ubiquitin-protein transferase activator activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding Клітинна компонента • екзосома • endoplasmic reticulum membrane • мембрана • integral component of endoplasmic reticulum membrane • Hrd1p ubiquitin ligase ERAD-L complex • integral component of membrane • ендоплазматичний ретикулум Біологічний процес • retrograde protein transport, ER to cytosol • ubiquitin-dependent ERAD pathway • GO:0048552 regulation of catalytic activity Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	550	11993
Ensembl	ENSG00000115307	ENSMUSG00000068328
UniProt	Q9Y679	P70295
RefSeq (мРНК)	NM_181575	NM_001025446 NM_001301649 NM_007517
RefSeq (білок)	NP_853553	NP_001288578 NP_031543
Локус (UCSC)	Хр. 2: 74.53 – 74.53 Mb	Хр. 6: 83.03 – 83.03 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

AUP1 (англ. Ancient ubiquitous protein 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 476 амінокислот, а молекулярна маса — 53 028.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MELPSGPGPE		RLFDSHRLPG		DCFLLLVLLL		YAPVGFCLLV		LRLFLGIHVF
LVSCALPDSV		LRRFVVRTMC		AVLGLVARQE		DSGLRDHSVR		VLISNHVTPF
DHNIVNLLTT		CSTVSESEAE		SATGRFPGAQ		LKAPLSPLAF		RMEDTEALPL
TPILYPTCQF		FFFIFLNIFL		LAFSSPGSQP		LLNSPPSFVC		WSRGFMEMNG
RGELVESLKR		FCASTRLPPT		PLLLFPEEEA		TNGREGLLRF		SSWPFSIQDV
VQPLTLQVQR		PLVSVTVSDA		SWVSELLWSL		FVPFTVYQVR		WLRPVHRQLG
EANEEFALRV		QQLVAKELGQ		TGTRLTPADK		AEHMKRQRHP		RLRPQSAQSS
FPPSPGPSPD		VQLATLAQRV		KEVLPHVPLG		VIQRDLAKTG		CVDLTITNLL
EGAVAFMPED		ITKGTQSLPT		ASASKFPSSG		PVTPQPTALT		FAKSSWARQE
SLQERKQALY		EYARRRFTER		RAQEAD

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як убіквітинування білків, ацетиляція, альтернативний сплайсинг. Локалізований у мембрані, ендоплазматичному ретикулумі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Mueller B., Klemm E.J., Spooner E., Claessen J.H., Ploegh H.L. (2008). SEL1L nucleates a protein complex required for dislocation of misfolded glycoproteins. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 105: 12325—12330. PMID 18711132 DOI:10.1073/pnas.0805371105

Див. також

• Хромосома 2