BABAM2

BABAM2
Ідентифікатори
Символи	BABAM2, BRCC4, BRCC45, BRE, brain and reproductive organ-expressed (TNFRSF1A modulator), BRISC and BRCA1 A complex member 2
Зовнішні ІД	OMIM: 610497 MGI: 1333875 HomoloGene: 3604 GeneCards: BABAM2
Онтологія гена Молекулярна функція • peroxisome targeting sequence binding • polyubiquitin modification-dependent protein binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • tumor necrosis factor receptor binding Клітинна компонента • nuclear ubiquitin ligase complex • нуклеоплазма • клітинне ядро • цитоплазма • гіалоплазма • BRCA1-A complex • BRISC complex Біологічний процес • response to ionizing radiation • GO:1900404 positive regulation of DNA repair • поділ клітини • protein K63-linked deubiquitination • клітинний цикл • double-strand break repair via nonhomologous end joining • GO:0072468 сигнальна трансдукція • GO:0097285 апоптоз • GO:0100026 Репарація ДНК • cellular response to DNA damage stimulus • double-strand break repair • protein deubiquitination • negative regulation of apoptotic process • mitotic G2 DNA damage checkpoint signaling • GO:0031497, GO:0006336, GO:0034724, GO:0001301, GO:0007580, GO:0034652, GO:0010847 chromatin organization Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	9577	107976
Ensembl	ENSG00000158019	ENSMUSG00000052139
UniProt	Q9NXR7	Q8K3W0
RefSeq (мРНК)	NM_001261840 NM_001329112 NM_001329113 NM_001329114 NM_001329115 NM_004899 NM_199191 NM_199192 NM_199193 NM_199194	NM_144541 NM_181279 NM_181280 NM_181281 NM_181282
RefSeq (білок)	NP_001248769 NP_001316041 NP_001316042 NP_001316043 NP_001316044 NP_004890 NP_954661 NP_954662 NP_954663 NP_954664	NP_653124 NP_851796 NP_851797 NP_851798 NP_851799
Локус (UCSC)	Хр. 2: 27.89 – 28.34 Mb	Хр. 5: 31.86 – 32.24 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

BABAM2 (англ. BRISC and BRCA1 A complex member 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 383 амінокислот, а молекулярна маса — 43 552.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MSPEVALNRI		SPMLSPFISS		VVRNGKVGLD		ATNCLRITDL		KSGCTSLTPG
PNCDRFKLHI		PYAGETLKWD		IIFNAQYPEL		PPDFIFGEDA		EFLPDPSALQ
NLASWNPSNP		ECLLLVVKEL		VQQYHQFQCS		RLRESSRLMF		EYQTLLEEPQ
YGENMEIYAG		KKNNWTGEFS		ARFLLKLPVD		FSNIPTYLLK		DVNEDPGEDV
ALLSVSFEDT		EATQVYPKLY		LSPRIEHALG		GSSALHIPAF		PGGGCLIDYV
PQVCHLLTNK		VQYVIQGYHK		RREYIAAFLS		HFGTGVVEYD		AEGFTKLTLL
LMWKDFCFLV		HIDLPLFFPR		DQPTLTFQSV		YHFTNSGQLY		SQAQKNYPYS
PRWDGNEMAK		RAKAYFKTFV		PQFQEAAFAN		GKL

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до регуляторів хроматину, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як апоптоз, клітинний цикл, поділ клітини, пошкодження ДНК, репарація ДНК, мітоз, убіквітинування білків, ацетиляція, альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

• Li L., Yoo H., Becker F.F., Ali-Osman F., Chan J.Y.-H. (1995). Identification of a brain- and reproductive-organs-specific gene responsive to DNA damage and retinoic acid. Biochem. Biophys. Res. Commun. 206: 764—774. PMID 7826398 DOI:10.1006/bbrc.1995.1108
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Wang B., Hurov K., Hofmann K., Elledge S.J. (2009). NBA1, a new player in the Brca1 A complex, is required for DNA damage resistance and checkpoint control. Genes Dev. 23: 729—739. PMID 19261749 DOI:10.1101/gad.1770309
• Feng L., Huang J., Chen J. (2009). MERIT40 facilitates BRCA1 localization and DNA damage repair. Genes Dev. 23: 719—728. PMID 19261748 DOI:10.1101/gad.1770609

Див. також

• Хромосома 2