BATF3

BATF3
Ідентифікатори
Символи	BATF3, JDP1, JUNDM1, SNFT, basic leucine zipper ATF-like transcription factor 3
Зовнішні ІД	OMIM: 612470 MGI: 1925491 HomoloGene: 41280 GeneCards: BATF3
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • DNA binding • GO:0001078, GO:0001214, GO:0001206 DNA-binding transcription repressor activity, RNA polymerase II-specific • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • GO:0001106 transcription corepressor activity • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific Клітинна компонента • клітинне ядро Біологічний процес • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • dendritic cell differentiation • response to virus • myeloid dendritic cell differentiation • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • transcription by RNA polymerase II • transcription, DNA-templated Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	55509	381319
Ensembl	ENSG00000123685	ENSMUSG00000026630
UniProt	Q9NR55	Q9D275
RefSeq (мРНК)	NM_018664	NM_030060
RefSeq (білок)	NP_061134	NP_084336
Локус (UCSC)	Хр. 1: 212.69 – 212.7 Mb	Хр. 1: 190.83 – 190.84 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

BATF3 (англ. Basic leucine zipper ATF-like transcription factor 3) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 1-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 127 амінокислот, а молекулярна маса — 14 468.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MSQGLPAAGS		VLQRSVAAPG		NQPQPQPQQQ		SPEDDDRKVR		RREKNRVAAQ
RSRKKQTQKA		DKLHEEYESL		EQENTMLRRE		IGKLTEELKH		LTEALKEHEK
MCPLLLCPMN		FVPVPPRPDP		VAGCLPR

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, активаторів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

• Iacobelli M., Wachsman W., McGuire K.L. (2000). Repression of IL-2 promoter activity by the novel basic leucine zipper p21SNFT protein. J. Immunol. 165: 860—868. PMID 10878360 DOI:10.4049/jimmunol.165.2.860
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Bower K.E., Zeller R.W., Wachsman W., Martinez T., McGuire K.L. (2002). Correlation of transcriptional repression by p21(SNFT) with changes in DNA.NF-AT complex interactions. J. Biol. Chem. 277: 34967—34977. PMID 12087103 DOI:10.1074/jbc.M205048200
• Bower K.E., Fritz J.M., McGuire K.L. (2004). Transcriptional repression of MMP-1 by p21SNFT and reduced in vitro invasiveness of hepatocarcinoma cells. Oncogene. 23: 8805—8814. PMID 15467742 DOI:10.1038/sj.onc.1208109

Див. також

• Хромосома 1