BMS1

BMS1
Ідентифікатори
Символи	BMS1, ACC, BMS1L, ribosome biogenesis factor, BMS1 ribosome biogenesis factor
Зовнішні ІД	OMIM: 611448 MGI: 2446132 HomoloGene: 7065 GeneCards: BMS1
Онтологія гена Молекулярна функція • nucleotide binding • ATP binding • U3 snoRNA binding • GO:0006184 GTPase activity • GTP binding • RNA binding Клітинна компонента • ядерце • клітинне ядро • нуклеоплазма • 90S preribosome Біологічний процес • ribosome assembly • ribosome biogenesis • maturation of SSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA) • rRNA processing • endonucleolytic cleavage of tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA) Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	9790	213895
Ensembl	ENSG00000165733	ENSMUSG00000030138
UniProt	Q14692	Q6PGF5
RefSeq (мРНК)	NM_014753	NM_194339
RefSeq (білок)	NP_055568	NP_919320
Локус (UCSC)	Хр. 10: 42.78 – 42.83 Mb	Хр. 6: 118.36 – 118.4 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

BMS1 (англ. BMS1, ribosome biogenesis factor) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 10-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 282 амінокислот, а молекулярна маса — 145 807.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MEAKDQKKHR		KKNSGPKAAK		KKKRLLQDLQ		LGDEEDARKR		NPKAFAVQSA
VRMARSFHRT		QDLKTKKHHI		PVVDRTPLEP		PPIVVVVMGP		PKVGKSTLIQ
CLIRNFTRQK		LTEIRGPVTI		VSGKKRRLTI		IECGCDINMM		IDLAKVADLV
LMLIDASFGF		EMETFEFLNI		CQVHGFPKIM		GVLTHLDSFK		HNKQLKKTKK
RLKHRFWTEV		YPGAKLFYLS		GMVHGEYQNQ		EIHNLGRFIT		VMKFRPLTWQ
TSHPYILADR		MEDLTNPEDI		RTNIKCDRKV		SLYGYLRGAH		LKNKSQIHMP
GVGDFAVSDI		SFLPDPCALP		EQQKKRCLNE		KEKLVYAPLS		GVGGVLYDKD
AVYVDLGGSH		VFQDEVGPTH		ELVQSLISTH		STIDAKMASS		RVTLFSDSKP
LGSEDIDNQG		LMMPKEEKQM		DLNTGRMRRK		AIFGDEDESG		DSDDEEDDEM
SEDDGLENGS		SDEEAEEEEN		AEMTDQYMAV		KGIKRRKLEL		EEDSEMDLPA
FADSDDDLER		SSAEEGEAEE		ADESSEEEDC		TAGEKGISGS		KAAGEGSKAG
LSPANCQSDR		VNLEKSLLMK		KAALPTFDSG		HCTAEEVFAS		EDESEESSSL
SAEEEDSENE		EAIRKKLSKP		SQVSSGQKLG		PQNFIDETSD		IENLLKEEED
YKEENNDSKE		TSGALKWKED		LSRKAAEAFL		RQQQAAPNLR		KLIYGTVTED
NEEEDDDTLE		ELGGLFRVNQ		PDRECKHKAD		SLDCSRFLVE		APHDWDLEEV
MNSIRDCFVT		GKWEDDKDAA		KVLAEDEELY		GDFEDLETGD		VHKGKSGPNT
QNEDIEKEVK		EEIDPDEEES		AKKKHLDKKR		KLKEMFDAEY		DEGESTYFDD
LKGEMQKQAQ		LNRAEFEDQD		DEARVQYEGF		RPGMYVRIEI		ENVPCEFVQN
FDPHYPIILG		GLGNSEGNVG		YVQMRLKKHR		WYKKILKSRD		PIIFSVGWRR
FQTIPLYYIE		DHNGRQRLLK		YTPQHMHCGA		AFWGPITPQG		TGFLAIQSVS
GIMPDFRIAA		TGVVLDLDKS		IKIVKKLKLT		GFPYKIFKNT		SFIKGMFNSA
LEVAKFEGAV		IRTVSGIRGQ		IKKALRAPEG		AFRASFEDKL		LMSDIVFMRT
WYPVSIPAFY		NPVTSLLKPV		GEKDTWSGMR		TTGQLRLAHG		VRLKANKDSL
YKPILRQKKH		FNSLHIPKAL		QKALPFKNKP		KTQAKAGKVP		KDRRRPAVIR
EPHERKILAL		LDALSTVHSQ		KMKKAKEQRH		LHNKEHFRAK		QKEEEEKLKR
QKDLRKKLFR		IQGQKERRNQ		KSSLKGAEGQ		LQ

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як біогенез рибосом. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами. Локалізований у ядрі.

Література

• Nagase T., Seki N., Ishikawa K., Tanaka A., Nomura N. (1996). Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. V. The coding sequences of 40 new genes (KIAA0161-KIAA0200) deduced by analysis of cDNA clones from human cell line KG-1. DNA Res. 3: 17—24. PMID 8724849 doi:10.1093/dnares/3.1.17
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
• Marneros A.G. (2013). BMS1 is mutated in aplasia cutis congenita. PLoS Genet. 9: E1003573—E1003573. PMID 23785305 doi:10.1371/journal.pgen.1003573
• Impens F., Radoshevich L., Cossart P., Ribet D. (2014). Mapping of SUMO sites and analysis of SUMOylation changes induced by external stimuli. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 111: 12432—12437. PMID 25114211 doi:10.1073/pnas.1413825111

Див. також

• Хромосома 10