BPI (ген)

BPI
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1BP1, 1EWF
Ідентифікатори
Символи	BPI, bactericidal/permeability-increasing protein, BPIFD1, rbactericidal permeability increasing protein
Зовнішні ІД	OMIM: 109195 MGI: 3045315 HomoloGene: 37519 GeneCards: BPI
Онтологія гена Молекулярна функція • lipid binding • lipopolysaccharide binding Клітинна компонента • екзосома • мембрана • цитоплазма • integral component of plasma membrane • extracellular region • міжклітинний простір • azurophil granule lumen • specific granule lumen • cytoplasmic stress granule Біологічний процес • negative regulation of interleukin-6 production • negative regulation of interleukin-8 production • defense response to bacterium • negative regulation of tumor necrosis factor production • negative regulation of macrophage activation • GO:0046730, GO:0046737, GO:0046738, GO:0046736 імунна відповідь • antimicrobial humoral response • neutrophil degranulation • GO:0051636 defense response to Gram-negative bacterium Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	671	329547
Ensembl	ENSG00000101425	ENSMUSG00000052922
UniProt	P17213	Q67E05
RefSeq (мРНК)	NM_001725	NM_177850 NM_001356542
RefSeq (білок)	NP_001716	NP_808518 NP_001343471
Локус (UCSC)	Хр. 20: 38.3 – 38.34 Mb	Хр. 2: 158.1 – 158.13 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

BPI (англ. Bactericidal/permeability-increasing protein) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 20-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 487 амінокислот, а молекулярна маса — 53 900.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MRENMARGPC		NAPRWASLMV		LVAIGTAVTA		AVNPGVVVRI		SQKGLDYASQ
QGTAALQKEL		KRIKIPDYSD		SFKIKHLGKG		HYSFYSMDIR		EFQLPSSQIS
MVPNVGLKFS		ISNANIKISG		KWKAQKRFLK		MSGNFDLSIE		GMSISADLKL
GSNPTSGKPT		ITCSSCSSHI		NSVHVHISKS		KVGWLIQLFH		KKIESALRNK
MNSQVCEKVT		NSVSSELQPY		FQTLPVMTKI		DSVAGINYGL		VAPPATTAET
LDVQMKGEFY		SENHHNPPPF		APPVMEFPAA		HDRMVYLGLS		DYFFNTAGLV
YQEAGVLKMT		LRDDMIPKES		KFRLTTKFFG		TFLPEVAKKF		PNMKIQIHVS
ASTPPHLSVQ		PTGLTFYPAV		DVQAFAVLPN		SSLASLFLIG		MHTTGSMEVS
AESNRLVGEL		KLDRLLLELK		HSNIGPFPVE		LLQDIMNYIV		PILVLPRVNE
KLQKGFPLPT		PARVQLYNVV		LQPHQNFLLF		GADVVYK

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до антибіотиків, антимікробних білків. Локалізований у мембрані. Також секретований назовні.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Beamer L.J., Carroll S.F., Eisenberg D. (1997). Crystal structure of human BPI and two bound phospholipids at 2.4-A resolution. Science. 276: 1861—1864. PMID 9188532 DOI:10.1126/science.276.5320.1861
• Kleiger G., Beamer L.J., Grothe R., Mallick P., Eisenberg D. (2000). The 1.7 A crystal structure of BPI: a study of how two dissimilar amino acid sequences can adopt the same fold. J. Mol. Biol. 299: 1019—1034. PMID 10843855 DOI:10.1006/jmbi.2000.3805
• Wasiluk K.R., Skubitz K.M., Gray B.H. (1991). Comparison of granule proteins from human polymorphonuclear leukocytes which are bactericidal toward Pseudomonas aeruginosa. Infect. Immun. 59: 4193—4200. PMID 1937776
• Ooi C.E., Weiss J., Elsbach P., Frangione B., Mannion B. (1987). A 25-kDa NH2-terminal fragment carries all the antibacterial activities of the human neutrophil 60-kDa bactericidal/permeability-increasing protein. J. Biol. Chem. 262: 14891—14894. PMID 3667613

Див. також

• Хромосома 20