BRAF

Матеріал з Вікіпедії — вільної енциклопедії.
Перейти до навігації Перейти до пошуку
BRAF
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Ідентифікатори
Символи BRAF, B-RAF1, BRAF1, NS7, RAFB1, B-Raf, B-Raf proto-oncogene, serine/threonine kinase
Зовнішні ІД OMIM: 164757 MGI: 88190 HomoloGene: 3197 GeneCards: BRAF
Пов'язані генетичні захворювання
колоректальний рак, негоджкінська лімфома, Noonan syndrome 7, adenocarcinoma of the lung, disease of cellular proliferation, меланома, недрібноклітинна карцинома легенів, large intestine cancer[1]
Реагує на сполуку
dabrafenib, регорафеніб, сорафеніб, вемурафеніб[2]
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)
NM_004333
NM_001354609
NM_001374244
NM_001374258
NM_139294
RefSeq (білок)
NP_647455
Локус (UCSC) Хр. 7: 140.72 – 140.92 Mb Хр. 6: 39.58 – 39.7 Mb
PubMed search [3] [4]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

BRAF, також відомий як протоонкоген B-Raf (англ. B-Raf proto-oncogene, serine/threonine kinase) – білок, який кодується геном BRAF, розташованим у людей на довгому плечі 7-ї хромосоми.[5][6][7] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 766 амінокислот, а молекулярна маса — 84 437[8]. BRAF впливає на нормальний ріст та диференціацію клітин та є складовою сигнального шляху MAPK/ERK.

Цей білок за функціями належить до серин/треонінових протеїнкіназ, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як ацетилювання, метилювання. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами, іоном цинку. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, ядрі.

Послідовність амінокислот
1020304050
MAALSGGGGGGAEPGQALFNGDMEPEAGAGAGAAASSAADPAIPEEVWNI
KQMIKLTQEHIEALLDKFGGEHNPPSIYLEAYEEYTSKLDALQQREQQLL
ESLGNGTDFSVSSSASMDTVTSSSSSSLSVLPSSLSVFQNPTDVARSNPK
SPQKPIVRVFLPNKQRTVVPARCGVTVRDSLKKALMMRGLIPECCAVYRI
QDGEKKPIGWDTDISWLTGEELHVEVLENVPLTTHNFVRKTFFTLAFCDF
CRKLLFQGFRCQTCGYKFHQRCSTEVPLMCVNYDQLDLLFVSKFFEHHPI
PQEEASLAETALTSGSSPSAPASDSIGPQILTSPSPSKSIPIPQPFRPAD
EDHRNQFGQRDRSSSAPNVHINTIEPVNIDDLIRDQGFRGDGGSTTGLSA
TPPASLPGSLTNVKALQKSPGPQRERKSSSSSEDRNRMKTLGRRDSSDDW
EIPDGQITVGQRIGSGSFGTVYKGKWHGDVAVKMLNVTAPTPQQLQAFKN
EVGVLRKTRHVNILLFMGYSTKPQLAIVTQWCEGSSLYHHLHIIETKFEM
IKLIDIARQTAQGMDYLHAKSIIHRDLKSNNIFLHEDLTVKIGDFGLATV
KSRWSGSHQFEQLSGSILWMAPEVIRMQDKNPYSFQSDVYAFGIVLYELM
TGQLPYSNINNRDQIIFMVGRGYLSPDLSKVRSNCPKAMKRLMAECLKKK
RDERPLFPQILASIELLARSLPKIHRSASEPSLNRAGFQTEDFSLYACAS
PKTPIQAGGYGAFPVH

Клінічне значення

[ред. | ред. код]

Мутації в BRAF часто зустрічаються при меланомі, колоректальному раку та папілярному раку щитоподібної залози.[9],[10],[11]

Література

[ред. | ред. код]
  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
  • Beausoleil S.A., Villen J., Gerber S.A., Rush J., Gygi S.P. (2006). A probability-based approach for high-throughput protein phosphorylation analysis and site localization. Nat. Biotechnol. 24: 1285—1292. PMID 16964243 DOI:10.1038/nbt1240
  • Eychene A., Barnier J.V., Apiou F., Dutrillaux B., Calothy G. (1992). Chromosomal assignment of two human B-raf(Rmil) proto-oncogene loci: B-raf-1 encoding the p94Braf/Rmil and B-raf-2, a processed pseudogene. Oncogene. 7: 1657—1660. PMID 1630826
  • Sithanandam G., Kolch W., Duh F.-M., Rapp U.R. (1990). Complete coding sequence of a human B-raf cDNA and detection of B-raf protein kinase with isozyme specific antibodies. Oncogene. 5: 1775—1780. PMID 2284096
  • Naoki K., Chen T.-H., Richards W.G., Sugarbaker D.J., Meyerson M. (2002). Missense mutations of the BRAF gene in human lung adenocarcinoma. Cancer Res. 62: 7001—7003. PMID 12460919
  • Hingorani S.R., Jacobetz M.A., Robertson G.P., Herlyn M., Tuveson D.A. (2003). Suppression of BRAF(V599E) in human melanoma abrogates transformation. Cancer Res. 63: 5198—5202. PMID 14500344

Примітки

[ред. | ред. код]
  1. Захворювання, генетично пов'язані з BRAF переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
  2. Сполуки, які фізично взаємодіють з BRAF (ген) переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
  3. Human PubMed Reference:.
  4. Mouse PubMed Reference:.
  5. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:1097 (англ.) . Архів оригіналу за 13 лютого 2018. Процитовано 12 лютого 2018.
  6. Sithanandam G, Kolch W, Duh FM, Rapp UR (December 1990). Complete coding sequence of a human B-raf cDNA and detection of B-raf protein kinase with isozyme specific antibodies. Oncogene. 5 (12): 1775—80. PMID 2284096.
  7. Sithanandam G, Druck T, Cannizzaro LA, Leuzzi G, Huebner K, Rapp UR (April 1992). B-raf and a B-raf pseudogene are located on 7q in man. Oncogene. 7 (4): 795—9. PMID 1565476.
  8. UniProt, P15056 (англ.) . Архів оригіналу за 13 лютого 2018. Процитовано 12 лютого 2018.
  9. King AJ, Patrick DR, Batorsky RS, Ho ML, Do HT, Zhang SY, Kumar R, Rusnak DW, Takle AK, Wilson DM, Hugger E, Wang L, Karreth F, Lougheed JC, Lee J, Chau D, Stout TJ, May EW, Rominger CM, Schaber MD, Luo L, Lakdawala AS, Adams JL, Contractor RG, Smalley KS, Herlyn M, Morrissey MM, Tuveson DA, Huang PS (December 2006). Demonstration of a genetic therapeutic index for tumors expressing oncogenic BRAF by the kinase inhibitor SB-590885. Cancer Res. 66 (23): 11100—5. doi:10.1158/0008-5472.CAN-06-2554. PMID 17145850.
  10. Tsai J, Lee JT, Wang W, Zhang J, Cho H, Mamo S, Bremer R, Gillette S, Kong J, Haass NK, Sproesser K, Li L, Smalley KS, Fong D, Zhu YL, Marimuthu A, Nguyen H, Lam B, Liu J, Cheung I, Rice J, Suzuki Y, Luu C, Settachatgul C, Shellooe R, Cantwell J, Kim SH, Schlessinger J, Zhang KY, West BL, Powell B, Habets G, Zhang C, Ibrahim PN, Hirth P, Artis DR, Herlyn M, Bollag G (February 2008). Discovery of a selective inhibitor of oncogenic B-Raf kinase with potent antimelanoma activity. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 105 (8): 3041—6. doi:10.1073/pnas.0711741105. PMC 2268581. PMID 18287029.
  11. Dinets A, Hulchiy M, Sofiadis A, Ghaderi M, Höög A, Larsson C, Zedenius J. (2012). Clinical, Genetic and Immunohistochemical Characterization of 70 Ukrainian Adult Cases with Post-Chornobyl Papillary Thyroid Carcinoma. Eur J Endocrinol. Epub ahead of print. doi:10.1530/EJE-12-0144. PMID 22457234.

Див. також

[ред. | ред. код]