BRPF1

BRPF1
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 4QYD, 5C7N, 4QYL, 5FFW, 5FFY, 4LC2, 2X4Y, 2X35, 2RS9, 2D9E, 3MO8, 5FFV, 5FG4, 2X4X, 3L42, 5FG5, 2X4W, 5ERC, 4UYE, 5C6S, 5EWD, 5EVA, 5C89, 5C85, 5E3G, 5DYC, 5C87, 5G4S, 5DY7, 5EM3, 5ETB, 5G4R, 5EWC, 5EWH, 5DYA, 5EPS, 5E3D, 5EQ1, 5ETD, 5EPR, 5D7X, 5EV9
Ідентифікатори
Символи	BRPF1, BR140, bromodomain and PHD finger containing 1, IDDDFP
Зовнішні ІД	OMIM: 602410 MGI: 1926033 HomoloGene: 31251 GeneCards: BRPF1
Онтологія гена Молекулярна функція • DNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • зв'язування з іоном металу • nucleic acid binding • histone acetyltransferase activity (H3-K23 specific) Клітинна компонента • MOZ/MORF histone acetyltransferase complex • клітинне ядро • нуклеоплазма • гіалоплазма • клітинна мембрана • цитоплазма Біологічний процес • GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • histone H3 acetylation • transcription, DNA-templated • regulation of signal transduction by p53 class mediator • histone H3-K23 acetylation • GO:0031497, GO:0006336, GO:0034724, GO:0001301, GO:0007580, GO:0034652, GO:0010847 chromatin organization Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	7862	78783
Ensembl	ENSG00000156983	ENSMUSG00000001632
UniProt	P55201	B2RRD7
RefSeq (мРНК)	NM_001003694 NM_004634 NM_001319049 NM_001319050	NM_001282126 NM_001282127 NM_001282128 NM_030178
RefSeq (білок)	NP_001003694 NP_001305978 NP_001305979 NP_004625	NP_001269055 NP_001269056 NP_001269057 NP_084454
Локус (UCSC)	Хр. 3: 9.73 – 9.75 Mb	Хр. 6: 113.28 – 113.3 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

BRPF1 (англ. Bromodomain and PHD finger containing 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 3-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 214 амінокислот, а молекулярна маса — 137 499.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MGVDFDVKTF		CHNLRATKPP		YECPVETCRK		VYKSYSGIEY		HLYHYDHDNP
PPPQQTPLRK		HKKKGRQSRP		ANKQSPSPSE		VSQSPGREVM		SYAQAQRMVE
VDLHGRVHRI		SIFDNLDVVS		EDEEAPEEAP		ENGSNKENTE		TPAATPKSGK
HKNKEKRKDS		NHHHHHNVSA		STTPKLPEVV		YRELEQDTPD		APPRPTSYYR
YIEKSAEELD		EEVEYDMDEE		DYIWLDIMNE		RRKTEGVSPI		PQEIFEYLMD
RLEKESYFES		HNKGDPNALV		DEDAVCCICN		DGECQNSNVI		LFCDMCNLAV
HQECYGVPYI		PEGQWLCRRC		LQSPSRAVDC		ALCPNKGGAF		KQTDDGRWAH
VVCALWIPEV		CFANTVFLEP		IDSIEHIPPA		RWKLTCYICK		QRGSGACIQC
HKANCYTAFH		VTCAQQAGLY		MKMEPVRETG		ANGTSFSVRK		TAYCDIHTPP
GSARRLPALS		HSEGEEDEDE		EEDEGKGWSS		EKVKKAKAKS		RIKMKKARKI
LAEKRAAAPV		VSVPCIPPHR		LSKITNRLTI		QRKSQFMQRL		HSYWTLKRQS
RNGVPLLRRL		QTHLQSQRNC		DQVGRDSEDK		NWALKEQLKS		WQRLRHDLER
ARLLVELIRK		REKLKRETIK		VQQIAMEMQL		TPFLILLRKT		LEQLQEKDTG
NIFSEPVPLS		EVPDYLDHIK		KPMDFFTMKQ		NLEAYRYLNF		DDFEEDFNLI
VSNCLKYNAK		DTIFYRAAVR		LREQGGAVLR		QARRQAEKMG		IDFETGMHIP
HSLAGDEATH		HTEDAAEEER		LVLLENQKHL		PVEEQLKLLL		ERLDEVNASK
QSVGRSRRAK		MIKKEMTALR		RKLAHQRETG		RDGPERHGPS		SRGSLTPHPA
ACDKDGQTDS		AAEESSSQET		SKGLGPNMSS		TPAHEVGRRT		SVLFSKKNPK
TAGPPKRPGR		PPKNRESQMT		PSHGGSPVGP		PQLPIMSSLR		QRKRGRSPRP
SSSSDSDSDK		STEDPPMDLP		ANGFSGGNQP		VKKSFLVYRN		DCSLPRSSSD
SESSSSSSSS		AASDRTSTTP		SKQGRGKPSF		SRGTFPEDSS		EDTSGTENEA
YSVGTGRGVG		HSMVRKSLGR		GAGWLSEDED		SPLDALDLVW		AKCRGYPSYP
ALIIDPKMPR		EGMFHHGVPI		PVPPLEVLKL		GEQMTQEARE		HLYLVLFFDN
KRTWQWLPRT		KLVPLGVNQD		LDKEKMLEGR		KSNIRKSVQI		AYHRALQHRS
KVQGEQSSET		SDSD

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до активаторів, регуляторів хроматину, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 3