C16orf62

C16orf62
Ідентифікатори
Символи	VPS35L, chromosome 16 open reading frame 62, VPS35 endosomal protein sorting factor like, C16orf62, EC97, RTSC3
Зовнішні ІД	MGI: 1918767 HomoloGene: 10659 GeneCards: VPS35L
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding Клітинна компонента • integral component of membrane • ендосома • early endosome • мембрана • клітинна мембрана • ficolin-1-rich granule membrane Біологічний процес • protein transport • Golgi to plasma membrane transport • neutrophil degranulation • endocytic recycling Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	57020	71517
Ensembl	ENSG00000103544	ENSMUSG00000030982
UniProt	Q7Z3J2	Q8BWQ6
RefSeq (мРНК)	NM_001300743 NM_020314 NM_001365293 NM_001365294 NM_001365295	NM_027815
RefSeq (білок)	NP_001287672 NP_064710 NP_001352222 NP_001352223 NP_001352224	NP_082091
Локус (UCSC)	Хр. 16: 19.56 – 19.71 Mb	Хр. 7: 118.34 – 118.44 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

C16orf62 (англ. Chromosome 16 open reading frame 62) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 16-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 963 амінокислот, а молекулярна маса — 109 563.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MAVFPWHSRN		RNYKAEFASC		RLEAVPLEFG		DYHPLKPITV		TESKTKKVNR
KGSTSSTSSS		SSSSVVDPLS		SVLDGTDPLS		MFAATADPAA		LAAAMDSSRR
KRDRDDNSVV		GSDFEPWTNK		RGEILARYTT		TEKLSINLFM		GSEKGKAGTA
TLAMSEKVRT		RLEELDDFEE		GSQKELLNLT		QQDYVNRIEE		LNQSLKDAWA
SDQKVKALKI		VIQCSKLLSD		TSVIQFYPSK		FVLITDILDT		FGKLVYERIF
SMCVDSRSVL		PDHFSPENAN		DTAKETCLNW		FFKIASIREL		IPRFYVEASI
LKCNKFLSKT		GISECLPRLT		CMIRGIGDPL		VSVYARAYLC		RVGMEVAPHL
KETLNKNFFD		FLLTFKQIHG		DTVQNQLVVQ		GVELPSYLPL		YPPAMDWIFQ
CISYHAPEAL		LTEMMERCKK		LGNNALLLNS		VMSAFRAEFI		ATRSMDFIGM
IKECDESGFP		KHLLFRSLGL		NLALADPPES		DRLQILNEAW		KVITKLKNPQ
DYINCAEVWV		EYTCKHFTKR		EVNTVLADVI		KHMTPDRAFE		DSYPQLQLII
KKVIAHFHDF		SVLFSVEKFL		PFLDMFQKES		VRVEVCKCIM		DAFIKHQQEP
TKDPVILNAL		LHVCKTMHDS		VNALTLEDEK		RMLSYLINGF		IKMVSFGRDF
EQQLSFYVES		RSMFCNLEPV		LVQLIHSVNR		LAMETRKVMK		GNHSRKTAAF
VRACVAYCFI		TIPSLAGIFT		RLNLYLHSGQ		VALANQCLSQ		ADAFFKAAIS
LVPEVPKMIN		IDGKMRPSES		FLLEFLCNFF		STLLIVPDHP		EHGVLFLVRE
LLNVIQDYTW		EDNSDEKIRI		YTCVLHLLSA		MSQETYLYHI		DKVDSNDSLY
GGDSKFLAEN		NKLCETVMAQ		ILEHLKTLAK		DEALKRQSSL		GLSFFNSILA
HGDLRNNKLN		QLSVNLWHLA		QRHGCADTRT		MVKTLEYIKK		QSKQPDMTHL
TELALRLPLQ		TRT

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транспорт, транспорт білків, альтернативний сплайсинг. Локалізований у мембрані, ендосомах.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 16