C20orf196

C20orf196
Ідентифікатори
Символи	SHLD1, chromosome 20 open reading frame 196, shieldin complex subunit 1, RINN3, C20orf196
Зовнішні ІД	OMIM: 618028 MGI: 1920997 HomoloGene: 51865 GeneCards: SHLD1
Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001948, GO:0016582 protein binding;
Клітинна компонента	• хромосома; • site of double-strand break;
Біологічний процес	• positive regulation of isotype switching; • negative regulation of double-strand break repair via homologous recombination; • positive regulation of double-strand break repair via nonhomologous end joining; • GO:0100026 Репарація ДНК; • cellular response to DNA damage stimulus; • regulation of double-strand break repair via nonhomologous end joining;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
	149840
	73747
	ENSG00000171984
	ENSMUSG00000044991
	Q8IYI0
	Q9D112
	NM_001303477; NM_001303478; NM_001303479; NM_152504
	NM_028637; NM_001358260; NM_001358261
	NP_001290406; NP_001290407; NP_001290408; NP_689717
	NP_082913; NP_001345189; NP_001345190
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

C20orf196 (англ. Chromosome 20 open reading frame 196) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 20-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 205 амінокислот, а молекулярна маса — 22 938^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MAARDATSGS	LSEESSALDL	PSACDIRDYV	LQGPSQEANS	EAFSSLEFHS
FPYSSDVDPD	TSNLNIEQNN	SWTAENFWLD	PAVKGQSEKE	EDDGLRKSLD
RFYEMFGHPQ	PGSANSLSAS	VCKCLSQKIT	QLRGQESQKY	ALRSFQMARV
IFNRDGCSVL	QRHSRDTHFY	PLEEGSTSLD	DEKPNPGLSK	DITHFLLQQN
VMKDL

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:26318 (англ.) . Процитовано 21 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, Q8IYI0 (англ.) . Архів оригіналу за 28 грудня 2016. Процитовано 21 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 20

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

Портал «Біологія» Портал «Хімія»

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:26318 (англ.) . Процитовано 21 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)

[UniProt-4] UniProt, Q8IYI0 (англ.) . Архів оригіналу за 28 грудня 2016. Процитовано 21 вересня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]