C6orf89

C6orf89
Ідентифікатори
Символи	C6orf89, BRAP, chromosome 6 open reading frame 89, PS1TP5TP1
Зовнішні ІД	OMIM: 616642 MGI: 2136782 HomoloGene: 12728 GeneCards: C6orf89
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding Клітинна компонента • integral component of membrane • комплекс Ґольджі • Golgi membrane • клітинне ядро • клітинна мембрана • ядерце • midbody • мембрана • цитоплазма Біологічний процес • positive regulation of histone deacetylase activity • epithelial cell proliferation • Загоєння ран • positive regulation of cell cycle Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	221477	80748
Ensembl	ENSG00000198663	ENSMUSG00000052712
UniProt	Q6UWU4	Q99KU6
RefSeq (мРНК)	NM_001286635 NM_001286636 NM_001286637 NM_152734	NM_030561
RefSeq (білок)	NP_001273564 NP_001273565 NP_001273566 NP_689947 NP_001273564.1	NP_085038
Локус (UCSC)	Хр. 6: 36.87 – 36.93 Mb	Хр. 17: 29.27 – 29.31 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

C6orf89 (англ. Chromosome 6 open reading frame 89) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 347 амінокислот, а молекулярна маса — 39 870.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MDLAANEISI		YDKLSETVDL		VRQTGHQCGM		SEKAIEKFIR		QLLEKNEPQR
PPPQYPLLIV		VYKVLATLGL		ILLTAYFVIQ		PFSPLAPEPV		LSGAHTWRSL
IHHIRLMSLP		IAKKYMSENK		GVPLHGGDED		RPFPDFDPWW		TNDCEQNESE
PIPANCTGCA		QKHLKVMLLE		DAPRKFERLH		PLVIKTGKPL		LEEEIQHFLC
QYPEATEGFS		EGFFAKWWRC		FPERWFPFPY		PWRRPLNRSQ		MLRELFPVFT
HLPFPKDASL		NKCSFLHPEP		VVGSKMHKMP		DLFIIGSGEA		MLQLIPPFQC
RRHCQSVAMP		IEPGDIGYVD		TTHWKVYVIA		RGVQPLVICD		GTAFSEL

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі, ядрі, мембрані, апараті гольджі.

Література

• Lalioti V.S., Vergarajauregui S., Villasante A., Pulido D., Sandoval I.V. (2013). C6orf89 encodes three distinct HDAC enhancers that function in the nucleolus, the Golgi and the midbody. J. Cell. Physiol. 228: 1907—1921. PMID 23460338 doi:10.1002/jcp.24355
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 6