CALD1

CALD1
Ідентифікатори
Символи	CALD1, CDM, H-CAD, HCAD, L-CAD, LCAD, NAG22, caldesmon 1, h-CD
Зовнішні ІД	OMIM: 114213 HomoloGene: 137424 GeneCards: CALD1
Онтологія гена Молекулярна функція • myosin binding • actin binding • tropomyosin binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • calmodulin binding • cadherin binding Клітинна компонента • цитоплазма • гіалоплазма • клітинна мембрана • міофібрила • цитоскелет • actin cytoskeleton • внутрішньоклітинна мембранна органела • мембрана • actin cap Біологічний процес • м'язове скорочення Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	800	25687
Ensembl	ENSG00000122786	ENSRNOG00000010233
UniProt	Q05682	Q62736
RefSeq (мРНК)	NM_004342 NM_033138 NM_033139 NM_033140 NM_033157	NM_013146
RefSeq (білок)	NP_004333 NP_149129 NP_149130 NP_149131 NP_149347	NP_037278
Локус (UCSC)	Хр. 7: 134.74 – 134.97 Mb	н/д
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

CALD1 (англ. Caldesmon 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 7-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 793 амінокислот, а молекулярна маса — 93 231.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MDDFERRREL		RRQKREEMRL		EAERIAYQRN		DDDEEEAARE		RRRRARQERL
RQKQEEESLG		QVTDQVEVNA		QNSVPDEEAK		TTTTNTQVEG		DDEAAFLERL
ARREERRQKR		LQEALERQKE		FDPTITDASL		SLPSRRMQND		TAENETTEKE
EKSESRQERY		EIEETETVTK		SYQKNDWRDA		EENKKEDKEK		EEEEEEKPKR
GSIGENQVEV		MVEEKTTESQ		EETVVMSLKN		GQISSEEPKQ		EEEREQGSDE
ISHHEKMEEE		DKERAEAERA		RLEAEERERI		KAEQDKKIAD		ERARIEAEEK
AAAQERERRE		AEERERMREE		EKRAAEERQR		IKEEEKRAAE		ERQRIKEEEK
RAAEERQRIK		EEEKRAAEER		QRARAEEEEK		AKVEEQKRNK		QLEEKKHAMQ
ETKIKGEKVE		QKIEGKWVNE		KKAQEDKLQT		AVLKKQGEEK		GTKVQAKREK
LQEDKPTFKK		EEIKDEKIKK		DKEPKEEVKS		FMDRKKGFTE		VKSQNGEFMT
HKLKHTENTF		SRPGGRASVD		TKEAEGAPQV		EAGKRLEELR		RRRGETESEE
FEKLKQKQQE		AALELEELKK		KREERRKVLE		EEEQRRKQEE		ADRKLREEEE
KRRLKEEIER		RRAEAAEKRQ		KMPEDGLSDD		KKPFKCFTPK		GSSLKIEERA
EFLNKSVQKS		SGVKSTHQAA		IVSKIDSRLE		QYTSAIEGTK		SAKPTKPAAS
DLPVPAEGVR		NIKSMWEKGN		VFSSPTAAGT		PNKETAGLKV		GVSSRINEWL
TKTPDGNKSP		APKPSDLRPG		DVSSKRNLWE		KQSVDKVTSP		TKV

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до м'язових білків, фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з молекулою актину, молекулою кальмодуліну. Локалізований у цитоплазмі, цитоскелеті.

Література

• Humphrey M.B., Herrera-Sosa H., Gonzalez G., Lee R., Bryan J. (1992). Cloning of cDNAs encoding human caldesmons. Gene. 112: 197—204. PMID 1555769 doi:10.1016/0378-1119(92)90376-Z
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
• Huber P.A.J., Redwood C.S., Avent N.D., Tanner M.J.A., Marston S.B. (1993). Identification of functioning regulatory sites and a new myosin binding site in the C-terminal 288 amino acids of caldesmon expressed from a human clone. J. Muscle Res. Cell Motil. 14: 385—391. PMID 8227296 doi:10.1007/BF00121289
• Novy R.E., Lin J.L.-C., Lin J.J.-C. (1991). Characterization of cDNA clones encoding a human fibroblast caldesmon isoform and analysis of caldesmon expression in normal and transformed cells. J. Biol. Chem. 266: 16917—16924. PMID 1885618

Див. також

• Хромосома 7