CBX1

CBX1
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 3Q6S, 2FMM, 3F2U
Ідентифікатори
Символи	CBX1, CBX, HP1-BETA, HP1Hs-beta, HP1Hsbeta, M31, MOD1, p25beta, chromobox 1
Зовнішні ІД	OMIM: 604511 MGI: 105369 HomoloGene: 89116 GeneCards: CBX1
Онтологія гена Молекулярна функція • histone methyltransferase binding • enzyme binding • chromatin binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • protein homodimerization activity • identical protein binding Клітинна компонента • chromocenter • pericentric heterochromatin • Хроматин • веретено поділу • центромера • male pronucleus • female pronucleus • нуклеоплазма • клітинне ядро • site of DNA damage Біологічний процес • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • cellular response to DNA damage stimulus Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	10951	12412
Ensembl	ENSG00000108468	ENSMUSG00000018666
UniProt	P83916	P83917
RefSeq (мРНК)	NM_006807 NM_001127228	NM_007622 NM_001362560 NM_001362561 NM_001362563 NM_001362564
RefSeq (білок)	NP_001120700 NP_006798	NP_031648 NP_001349489 NP_001349490 NP_001349492 NP_001349493
Локус (UCSC)	Хр. 17: 48.07 – 48.1 Mb	Хр. 11: 96.68 – 96.7 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

CBX1 (англ. Chromobox 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 17-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 185 амінокислот, а молекулярна маса — 21 418.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MGKKQNKKKV		EEVLEEEEEE		YVVEKVLDRR		VVKGKVEYLL		KWKGFSDEDN
TWEPEENLDC		PDLIAEFLQS		QKTAHETDKS		EGGKRKADSD		SEDKGEESKP
KKKKEESEKP		RGFARGLEPE		RIIGATDSSG		ELMFLMKWKN		SDEADLVPAK
EANVKCPQVV		ISFYEERLTW		HSYPSEDDDK		KDDKN

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Локалізований у ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
• Minc E., Allory Y., Worman H.J., Courvalin J.-C., Buendia B. (1999). Localization and phosphorylation of HP1 proteins during the cell cycle in mammalian cells. Chromosoma. 108: 220—234. PMID 10460410 doi:10.1007/s004120050372
• Chaturvedi P., Parnaik V.K. (2010). Lamin A rod domain mutants target heterochromatin protein 1alpha and beta for proteasomal degradation by activation of F-box protein, FBXW10. PLoS ONE. 5: E10620—E10620. PMID 20498703 doi:10.1371/journal.pone.0010620
• Huang Y., Myers M.P., Xu R.-M. (2006). Crystal structure of the HP1-EMSY complex reveals an unusual mode of HP1 binding. Structure. 14: 703—712. PMID 16615912 doi:10.1016/j.str.2006.01.007

Див. також

• Хромосома 17