CDH12

CDH12
Ідентифікатори
Символи	CDH12, CDHB, cadherin 12
Зовнішні ІД	OMIM: 600562 MGI: 109503 HomoloGene: 37873 GeneCards: CDH12
Онтологія гена Молекулярна функція • calcium ion binding • зв'язування з іоном металу • cytoskeletal protein binding • protein homodimerization activity • cadherin binding Клітинна компонента • integral component of membrane • клітинна мембрана • мембрана • cell surface • catenin complex Біологічний процес • адгезія клітин • adherens junction organization • homophilic cell adhesion via plasma membrane adhesion molecules • cell-cell junction assembly • calcium-dependent cell-cell adhesion via plasma membrane cell adhesion molecules • cell-cell adhesion mediated by cadherin • cell-cell adhesion • GO:0000767 cell morphogenesis Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	1010	215654
Ensembl	ENSG00000154162	ENSMUSG00000040452
UniProt	P55289	Q5RJH3
RefSeq (мРНК)	NM_004061 NM_001317227 NM_001317228	NM_001008420
RefSeq (білок)	NP_001304156 NP_001304157 NP_004052 NP_001351033 NP_001351034 NP_001351035 NP_001351036 NP_001351037 NP_001351038	NP_001008420
Локус (UCSC)	Хр. 5: 21.75 – 22.85 Mb	Хр. 15: 20.45 – 21.59 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

CDH12 (англ. Cadherin 12) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 794 амінокислот, а молекулярна маса — 88 332.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MLTRNCLSLL		LWVLFDGGLL		TPLQPQPQQT		LATEPRENVI		HLPGQRSHFQ
RVKRGWVWNQ		FFVLEEYVGS		EPQYVGKLHS		DLDKGEGTVK		YTLSGDGAGT
VFTIDETTGD		IHAIRSLDRE		EKPFYTLRAQ		AVDIETRKPL		EPESEFIIKV
QDINDNEPKF		LDGPYVATVP		EMSPVGAYVL		QVKATDADDP		TYGNSARVVY
SILQGQPYFS		IDPKTGVIRT		ALPNMDREVK		EQYQVLIQAK		DMGGQLGGLA
GTTIVNITLT		DVNDNPPRFP		KSIFHLKVPE		SSPIGSAIGR		IRAVDPDFGQ
NAEIEYNIVP		GDGGNLFDIV		TDEDTQEGVI		KLKKPLDFET		KKAYTFKVEA
SNLHLDHRFH		SAGPFKDTAT		VKISVLDVDE		PPVFSKPLYT		MEVYEDTPVG
TIIGAVTAQD		LDVGSSAVRY		FIDWKSDGDS		YFTIDGNEGT		IATNELLDRE
STAQYNFSII		ASKVSNPLLT		SKVNILINVL		DVNEFPPEIS		VPYETAVCEN
AKPGQIIQIV		SAADRDLSPA		GQQFSFRLSP		EAAIKPNFTV		RDFRNNTAGI
ETRRNGYSRR		QQELYFLPVV		IEDSSYPVQS		STNTMTIRVC		RCDSDGTILS
CNVEAIFLPV		GLSTGALIAI		LLCIVILLAI		VVLYVALRRQ		KKKDTLMTSK
EDIRDNVIHY		DDEGGGEEDT		QAFDIGALRN		PKVIEENKIR		RDIKPDSLCL
PRQRPPMEDN		TDIRDFIHQR		LQENDVDPTA		PPYDSLATYA		YEGSGSVAES
LSSIDSLTTE		ADQDYDYLTD		WGPRFKVLAD		MFGEEESYNP		DKVT

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як клітинна адгезія, поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном кальцію. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
• Tanihara H., Sano K., Heimark R.L., St John T., Suzuki S. (1994). Cloning of five human cadherins clarifies characteristic features of cadherin extracellular domain and provides further evidence for two structurally different types of cadherin. Cell Adhes. Commun. 2: 15—26. PMID 7982033

Див. також

• Хромосома 5