CDH18

CDH18
Ідентифікатори
Символи	CDH18, CDH14, CDH14L, CDH24, cadherin 18
Зовнішні ІД	OMIM: 603019 MGI: 1344366 HomoloGene: 55858 GeneCards: CDH18
Онтологія гена Молекулярна функція • calcium ion binding • зв'язування з іоном металу • cytoskeletal protein binding • protein homodimerization activity • cadherin binding Клітинна компонента • integral component of membrane • клітинна мембрана • мембрана • cell surface • catenin complex Біологічний процес • адгезія клітин • adherens junction organization • homophilic cell adhesion via plasma membrane adhesion molecules • cell-cell junction assembly • calcium-dependent cell-cell adhesion via plasma membrane cell adhesion molecules • cell-cell adhesion mediated by cadherin • cell-cell adhesion • GO:0000767 cell morphogenesis Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	1016	320865
Ensembl	ENSG00000145526	ENSMUSG00000040420
UniProt	Q13634	н/д
RefSeq (мРНК)	NM_001167667 NM_001291956 NM_001291957 NM_004934 NM_001349556 NM_001349558 NM_001349559 NM_001349560 NM_001349561 NM_001349562 NM_001349563	NM_001081299
RefSeq (білок)	NP_001161139 NP_001278885 NP_001278886 NP_004925 NP_001336485 NP_001336487 NP_001336488 NP_001336489 NP_001336490 NP_001336491 NP_001336492	н/д
Локус (UCSC)	Хр. 5: 19.47 – 20.58 Mb	Хр. 15: 22.55 – 23.47 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

CDH18 (англ. Cadherin 18) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 5-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 790 амінокислот, а молекулярна маса — 88 073.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MKITSTSCIC		PVLVCLCFVQ		RCYGTAHHSS		IKVMRNQTKH		IEGETEVHHR
PKRGWVWNQF		FVLEEHMGPD		PQYVGKLHSN		SDKGDGSVKY		ILTGEGAGTI
FIIDDTTGDI		HSTKSLDREQ		KTHYVLHAQA		IDRRTNKPLE		PESEFIIKVQ
DINDNAPKFT		DGPYIVTVPE		MSDMGTSVLQ		VTATDADDPT		YGNSARVVYS
ILQGQPYFSV		DPKTGVIRTA		LHNMDREARE		HYSVVIQAKD		MAGQVGGLSG
STTVNITLTD		VNDNPPRFPQ		KHYQLYVPES		AQVGSAVGKI		KANDADTGSN
ADMTYSIING		DGMGIFSIST		DKETREGILS		LKKPLNYEKK		KSYTLNIEGA
NTHLDFRFSH		LGPFKDATML		KIIVGDVDEP		PLFSMPSYLM		EVYENAKIGT
VVGTVLAQDP		DSTNSLVRYF		INYNVEDDRF		FNIDANTGTI		RTTKVLDREE
TPWYNITVTA		SEIDNPDLLS		HVTVGIRVLD		VNDNPPELAR		EYDIIVCENS
KPGQVIHTIS		ATDKDDFANG		PRFNFFLDER		LPVNPNFTLK		DNEDNTASIL
TRRRRFSRTV		QDVYYLPIMI		SDGGIPSLSS		SSTLTIRVCA		CERDGRVRTC
HAEAFLSSAG		LSTGALIAIL		LCVLILLAIV		VLFITLRRSK		KEPLIISEED
VRENVVTYDD		EGGGEEDTEA		FDITALRNPS		AAEELKYRRD		IRPEVKLTPR
HQTSSTLESI		DVQEFIKQRL		AEADLDPSVP		PYDSLQTYAY		EGQRSEAGSI
SSLDSATTQS		DQDYHYLGDW		GPEFKKLAEL		YGEIESERTT

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як клітинна адгезія, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном кальцію. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані.

Література

• Shibata T., Shimoyama Y., Gotoh M., Hirohashi S. (1997). Identification of human cadherin-14, a novel neurally specific type II cadherin, by protein interaction cloning. J. Biol. Chem. 272: 5236—5240. PMID 9030594 DOI:10.1074/jbc.272.8.5236
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 5