CDH26

CDH26
Ідентифікатори
Символи	CDH26, VR20, cadherin 26
Зовнішні ІД	OMIM: 617685 MGI: 2685856 HomoloGene: 18643 GeneCards: CDH26
Онтологія гена Молекулярна функція • calcium ion binding • зв'язування з іоном металу • integrin binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • beta-catenin binding • cytoskeletal protein binding • protein homodimerization activity • alpha-catenin binding • cadherin binding • delta-catenin binding Клітинна компонента • integral component of membrane • клітинна мембрана • мембрана • cell surface • catenin complex Біологічний процес • адгезія клітин • homophilic cell adhesion via plasma membrane adhesion molecules • cell-cell junction assembly • calcium-dependent cell-cell adhesion via plasma membrane cell adhesion molecules • adherens junction organization • CD4-positive, alpha-beta T cell activation • cell-cell adhesion mediated by cadherin • cell-cell adhesion • GO:0000767 cell morphogenesis Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	60437	381409
Ensembl	ENSG00000124215	ENSMUSG00000039155
UniProt	Q8IXH8	P59862
RefSeq (мРНК)	NM_021810 NM_177980 NM_001348204	NM_001291189 NM_198656
RefSeq (білок)	NP_068582 NP_817089 NP_001335133	NP_001278118 NP_941058
Локус (UCSC)	Хр. 20: 59.96 – 60.03 Mb	Хр. 2: 178.07 – 178.13 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

CDH26 (англ. Cadherin 26) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на довгому плечі 20-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 852 амінокислот, а молекулярна маса — 95 278.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MAMRSGRHPS		LLLLLVLLLW		LLQVSIIDSV		QQETDDLTKQ		TKEKIYQPLR
RSKRRWVITT		LELEEEDPGP		FPKLIGELFN		NMSYNMSLMY		LISGPGVDEY
PEIGLFSLED		HENGRIYVHR		PVDREMTPSF		TVYFDVVERS		TGKIVDTSLI
FNIRISDVND		HAPQFPEKEF		NITVQENQSA		GQPIFQMLAV		DLDEENTPNS
QVLYFLISQT		PLLKESGFRV		DRLSGEIRLS		GCLDYETAPQ		FTLLIRARDC
GEPSLSSTTT		VHVDVQEGNN		HRPAFTQENY		KVQIPEGRAS		QGVLRLLVQD
RDSPFTSAWR		AKFNILHGNE		EGHFDISTDP		ETNEGILNVI		KPLDYETRPA
QSLIIVVENE		ERLVFCERGK		LQPPRKAAAS		ATVSVQVTDA		NDPPAFHPQS
FIVNKEEGAR		PGTLLGTFNA		MDPDSQIRYE		LVHDPANWVS		VDKNSGVVIT
VEPIDRESPH		VNNSFYVIII		HAVDDGFPPQ		TATGTLMLFL		SDINDNVPTL
RPRSRYMEVC		ESAVHEPLHI		EAEDPDLEPF		SDPFTFELDN		TWGNAEDTWK
LGRNWGQSVE		LLTLRSLPRG		NYLVPLFIGD		KQGLSQKQTV		HVRICPCASG
LTCVELADAE		VGLHVGALFP		VCAAFVALAV		ALLFLLRCYF		VLEPKRHGCS
VSNDEGHQTL		VMYNAESKGT		SAQTWSDVEG		QRPALLICTA		AAGPTQGVKA
YPDATMHRQL		LAPVEGRMAE		TLNQSKERNR		FSLSRGCIIP		QGRATAGRGL
PQDIYKEMMP		RRLTQTGKRK		HGALARTPSF		KKVVYDHKED		EENKAGRKQR
SHLFKVMQLR		NEQGGVRVQS		AHSPSPLNKK		ACFPGDYRGE		SAGGHNCRAV
SG

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах, як клітинна адгезія, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном кальцію. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 20