CDH3

CDH3
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 4OY9
Ідентифікатори
Символи	CDH3, CDHP, HJMD, PCAD, cadherin 3
Зовнішні ІД	OMIM: 114021 HomoloGene: 20425 GeneCards: CDH3
Пов'язані генетичні захворювання
hypotrichosis with juvenile macular dystrophy, EEM syndrome
Онтологія гена Молекулярна функція • calcium ion binding • зв'язування з іоном металу • молекулярна функція • cytoskeletal protein binding • protein homodimerization activity • cadherin binding Клітинна компонента • цитоплазма • integral component of membrane • мембрана • клітинна мембрана • cell surface • catenin complex Біологічний процес • hair cycle process • positive regulation of keratinocyte proliferation • negative regulation of timing of catagen • відповідь на стимул • keratinization • Загоєння ран • regulation of hair cycle by canonical Wnt signaling pathway • negative regulation of transforming growth factor beta2 production • positive regulation of tyrosinase activity • retina homeostasis • GO:1901313 positive regulation of gene expression • адгезія клітин • positive regulation of insulin-like growth factor receptor signaling pathway • canonical Wnt signaling pathway • positive regulation of melanin biosynthetic process • positive regulation of melanosome transport • adherens junction organization • зір • homophilic cell adhesion via plasma membrane adhesion molecules • cell-cell adhesion • positive regulation of canonical Wnt signaling pathway • cell-cell junction assembly • calcium-dependent cell-cell adhesion via plasma membrane cell adhesion molecules • cell-cell adhesion mediated by cadherin • GO:0000767 cell morphogenesis Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	1001	116777
Ensembl	ENSG00000062038	ENSRNOG00000020129
UniProt	P22223	F1LMI3
RefSeq (мРНК)	NM_001793 NM_001317195 NM_001317196	NM_053938
RefSeq (білок)	NP_001304124 NP_001304125 NP_001784	NP_446390
Локус (UCSC)	Хр. 16: 68.64 – 68.73 Mb	н/д
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

CDH3 (англ. Cadherin 3) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 16-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 829 амінокислот, а молекулярна маса — 91 418.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MGLPRGPLAS		LLLLQVCWLQ		CAASEPCRAV		FREAEVTLEA		GGAEQEPGQA
LGKVFMGCPG		QEPALFSTDN		DDFTVRNGET		VQERRSLKER		NPLKIFPSKR
ILRRHKRDWV		VAPISVPENG		KGPFPQRLNQ		LKSNKDRDTK		IFYSITGPGA
DSPPEGVFAV		EKETGWLLLN		KPLDREEIAK		YELFGHAVSE		NGASVEDPMN
ISIIVTDQND		HKPKFTQDTF		RGSVLEGVLP		GTSVMQVTAT		DEDDAIYTYN
GVVAYSIHSQ		EPKDPHDLMF		TIHRSTGTIS		VISSGLDREK		VPEYTLTIQA
TDMDGDGSTT		TAVAVVEILD		ANDNAPMFDP		QKYEAHVPEN		AVGHEVQRLT
VTDLDAPNSP		AWRATYLIMG		GDDGDHFTIT		THPESNQGIL		TTRKGLDFEA
KNQHTLYVEV		TNEAPFVLKL		PTSTATIVVH		VEDVNEAPVF		VPPSKVVEVQ
EGIPTGEPVC		VYTAEDPDKE		NQKISYRILR		DPAGWLAMDP		DSGQVTAVGT
LDREDEQFVR		NNIYEVMVLA		MDNGSPPTTG		TGTLLLTLID		VNDHGPVPEP
RQITICNQSP		VRQVLNITDK		DLSPHTSPFQ		AQLTDDSDIY		WTAEVNEEGD
TVVLSLKKFL		KQDTYDVHLS		LSDHGNKEQL		TVIRATVCDC		HGHVETCPGP
WKGGFILPVL		GAVLALLFLL		LVLLLLVRKK		RKIKEPLLLP		EDDTRDNVFY
YGEEGGGEED		QDYDITQLHR		GLEARPEVVL		RNDVAPTIIP		TPMYRPRPAN
PDEIGNFIIE		NLKAANTDPT		APPYDTLLVF		DYEGSGSDAA		SLSSLTSSAS
DQDQDYDYLN		EWGSRFKKLA		DMYGGGEDD

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах, як клітинна адгезія, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном кальцію. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Bhatt A.S., Erdjument-Bromage H., Tempst P., Craik C.S., Moasser M.M. (2005). Adhesion signaling by a novel mitotic substrate of src kinases. Oncogene. 24: 5333—5343. PMID 16007225 DOI:10.1038/sj.onc.1208582

Див. також

• Хромосома 16