CDHR3

CDHR3
Ідентифікатори
Символи	CDHR3, CDH28, cadherin related family member 3
Зовнішні ІД	OMIM: 615610 MGI: 1916014 HomoloGene: 45146 GeneCards: CDHR3
Пов'язані генетичні захворювання
бронхіальна астма
Онтологія гена Молекулярна функція • calcium ion binding • virus receptor activity • cytoskeletal protein binding • protein homodimerization activity • cadherin binding Клітинна компонента • integral component of membrane • клітинна мембрана • мембрана • cell surface • catenin complex Біологічний процес • viral entry into host cell • адгезія клітин • GO:0022415 viral process • homophilic cell adhesion via plasma membrane adhesion molecules • cell-cell junction assembly • calcium-dependent cell-cell adhesion via plasma membrane cell adhesion molecules • adherens junction organization • cell-cell adhesion mediated by cadherin • cell-cell adhesion • GO:0000767 cell morphogenesis Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	222256	68764
Ensembl	ENSG00000128536	ENSMUSG00000035860
UniProt	Q6ZTQ4	Q8BL00
RefSeq (мРНК)	NM_001301161 NM_152750	NM_001024478
RefSeq (білок)	NP_001288090 NP_689963	NP_001019649
Локус (UCSC)	Хр. 7: 105.88 – 106.04 Mb	Хр. 12: 33.08 – 33.14 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

CDHR3 (англ. Cadherin related family member 3) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 7-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 885 амінокислот, а молекулярна маса — 97 977.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MQEAIILLAL		LGAMSGGEAL		HLILLPATGN		VAENSPPGTS		VHKFSVKLSA
SLSPVIPGFP		QIVNSNPLTE		AFRVNWLSGT		YFEVVTTGME		QLDFETGPNI
FDLQIYVKDE		VGVTDLQVLT		VQVTDVNEPP		QFQGNLAEGL		HLYIVERANP
GFIYQVEAFD		PEDTSRNIPL		SYFLISPPKS		FRMSANGTLF		STTELDFEAG
HRSFHLIVEV		RDSGGLKAST		ELQVNIVNLN		DEVPRFTSPT		RVYTVLEELS
PGTIVANITA		EDPDDEGFPS		HLLYSITTVS		KYFMINQLTG		TIQVAQRIDR
DAGELRQNPT		ISLEVLVKDR		PYGGQENRIQ		ITFIVEDVND		NPATCQKFTF
SIMVPERTAK		GTLLLDLNKF		CFDDDSEAPN		NRFNFTMPSG		VGSGSRFLQD
PAGSGKIVLI		GDLDYENPSN		LAAGNKYTVI		IQVQDVAPPY		YKNNVYVYIL
TSPENEFPLI		FDRPSYVFDV		SERRPARTRV		GQVRATDKDL		PQSSLLYSIS
TGGASLQYPN		VFWINPKTGE		LQLVTKVDCE		TTPIYILRIQ		ATNNEDTSSV
TVTVNILEEN		DEKPICTPNS		YFLALPVDLK		VGTNIQNFKL		TCTDLDSSPR
SFRYSIGPGN		VNNHFTFSPN		AGSNVTRLLL		TSRFDYAGGF		DKIWDYKLLV
YVTDDNLMSD		RKKAEALVET		GTVTLSIKVI		PHPTTIITTT		PRPRVTYQVL
RKNVYSPSAW		YVPFVITLGS		ILLLGLLVYL		VVLLAKAIHR		HCPCKTGKNK
EPLTKKGETK		TAERDVVVET		IQMNTIFDGE		AIDPVTGETY		EFNSKTGARK
WKDPLTQMPK		WKESSHQGAA		PRRVTAGEGM		GSLRSANWEE		DELSGKAWAE
DAGLGSRNEG		GKLGNPKNRN		PAFMNRAYPK		PHPGK

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до рецепторів клітини-хазяїна для входу вірусу, рецепторів. Задіяний у таких біологічних процесах, як клітинна адгезія, взаємодія хазяїн-вірус, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іоном кальцію. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 7